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限制性?xún)?nèi)切酶對(duì)DNA消化的方案

時(shí)間:2016/2/15閱讀:584
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    限制性?xún)?nèi)切酶可特異地結(jié)合于一段被稱(chēng)為限制酶識(shí)別序列的DNA序列位點(diǎn)上并在此切割雙鏈DNA。絕大多數(shù)限制性?xún)?nèi)切酶識(shí)別長(zhǎng)度為4、5或6個(gè)核苷酸且呈二重對(duì)稱(chēng)的特異序列,切割位點(diǎn)相對(duì)于二重對(duì)稱(chēng)軸的位置因酶而異。一些酶恰在對(duì)稱(chēng)軸處同時(shí)切割DNA雙鏈而產(chǎn)生帶平端的DNA片段,另一些酶則在對(duì)稱(chēng)軸兩側(cè)相對(duì)的位置上分別切斷兩條鏈,產(chǎn)生帶有單鏈突出端(即粘端)的DNA片段。

    1個(gè)單位限制性?xún)?nèi)切酶是指在zui適條件下,在50μl體積1小時(shí)內(nèi)*切開(kāi)1μgλ噬菌體DNA所需的酶量。不同的限制性?xún)?nèi)切酶往往推薦使用截然不同的反應(yīng)條件,甚至對(duì)同一種酶也如此。但是,幾乎所有的都對(duì)其的酶制劑優(yōu)化過(guò)反應(yīng)條件,因此購(gòu)買(mǎi)的內(nèi)切酶說(shuō)明書(shū)上均有其識(shí)別序列和切割位點(diǎn),同時(shí)提供有酶切緩沖液(buffer,10×、5×)和zui適條件,使得酶切反應(yīng)變得日益簡(jiǎn)單。ELISA試劑盒

一、限制性?xún)?nèi)切酶對(duì)DNA消化的一般方案

1.限制性?xún)?nèi)切酶反應(yīng)一般在滅菌的0.5ml離心管中進(jìn)行。

2.20μl體積反應(yīng)體系如下:

DNA 0.2-1 μg

10×酶切buffer 2.0 μl

限制性?xún)?nèi)切酶 1-2 u(單位)

加ddH2O 至 20 μl

限制性?xún)?nèi)切酶zui后加入,輕輕混勻,稍加離心,放置于zui適溫度水浴并按所需的時(shí)間溫育,一般為37℃水浴消化1hr。

3.用于回收酶切片段時(shí),反應(yīng)總體積可達(dá)50-200μl,各反應(yīng)組分需相應(yīng)增加。

4.多種酶消化時(shí)若緩沖液條件相同,可同時(shí)加入;否則,先做低溫或低鹽的酶消化,再做高溫或高鹽的酶消化。ELISA試劑盒

5.酶切結(jié)束時(shí),加入0.5M EDTA(pH 8.0)使終濃度達(dá)10mM,以終止反應(yīng)?;?qū)⒎磻?yīng)管在65℃水浴放置10min以滅活限制性?xún)?nèi)切酶活性。

6.如消化反應(yīng)體積過(guò)大,電泳時(shí)加樣孔盛不下,可加以濃縮:終止反應(yīng)后,加入0.6體積的5M乙酸銨(或1/10體積3M NaAc)和2倍體積無(wú)水乙醇,在冰上放置5min,然后于4℃離心12000g× 5min。傾去含大部分蛋白質(zhì)的上清液。于室溫晾干DNA沉淀后溶于適量TE中(pH 7.6)。

7.如要純化消化后的DNA,可用等體積酚/(1∶1)和各抽提一次,再用乙醇沉淀。

二、電泳檢測(cè)

取質(zhì)粒酶切產(chǎn)物適量,加適當(dāng)loading buffer混勻上樣,以未經(jīng)酶切的質(zhì)?;?和酶切的空載體(如有)作對(duì)照,采用 1-5V/cm的電壓,使DNA分子從負(fù)極向正極移動(dòng),至合適位置取出置紫外燈下檢測(cè),攝片。

三、注意事項(xiàng)

1. 濃縮的限制性?xún)?nèi)切酶可在使用前以1×限制酶緩沖液稀釋?zhuān)形鹩盟♂屢悦饷缸冃浴?/p>

2. 購(gòu)買(mǎi)的限制性?xún)?nèi)切酶多保存于50%甘油中,于-20℃是穩(wěn)定的。進(jìn)行酶切消化時(shí),將除酶以外的所有反應(yīng)成分加入后即混勻,再?gòu)?20℃冰箱中取出酶,立即放置于冰上。每次取酶時(shí)都應(yīng)更換一個(gè)無(wú)菌吸頭,以免酶被污染。加酶的操作盡可能快,用完后立即將酶放回-20℃冰箱。

3.盡量減少反應(yīng)體積,但要確保酶體積不超過(guò)反應(yīng)總體積的10%,否則酶活性將受到甘油的抑制。

4.通常延長(zhǎng)時(shí)間可使所需的酶量減少,在切割大量DNA時(shí)可用。在消化過(guò)程中可取少量反應(yīng)液進(jìn)行微量凝膠電泳以檢測(cè)消化進(jìn)程。ELISA試劑盒

5.注意星號(hào)酶切活力。

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