Asp、Glu、Lys、Ser、Thr、Tyr和PQM交聯(lián)劑

小分子交聯(lián)劑對于探測生物分子間的相互作用和在處理大型蛋白復(fù)合物和內(nèi)在無序蛋白時的交聯(lián)質(zhì)譜(CXMS)是寶貴的?，F(xiàn)有的化學(xué)交聯(lián)劑只針對一小部分氨基酸殘基，了交聯(lián)的數(shù)量和類型，而傳統(tǒng)的光交聯(lián)劑幾乎不選擇性地針對殘基，使數(shù)據(jù)分析變得復(fù)雜。

設(shè)計合成了基于光保護的喹酮甲基化(PQM)的一系列交聯(lián)劑，能夠通過某些的Michael加成靶向9個親核殘基。除了Asp、Glu、Lys、Ser、Thr和Tyr外，PQM交聯(lián)劑還地交聯(lián)了Gln、Arg和Asn，，這些化學(xué)交聯(lián)劑還不能作為靶點，用單一交聯(lián)劑地增加了靶點殘基的數(shù)量。

初設(shè)計了一種含NHS酯基和光保護ortho-QM(o-QM)的雙功能交聯(lián)劑NHQM。鄰硝基芐基在酚羥基上的鄰位甲基上連接了兩個氟原子，當加入到蛋白中時，NHS會很快和暴露的Lys殘基反應(yīng)，將光保護的o-QM放置在相互作用蛋白的殘基旁邊，o-硝基芐基在紫外線照射下被，生成o-QM，并與附近的親核側(cè)鏈發(fā)生交聯(lián)。

為了增加交聯(lián)劑的靈活性，還合成了NHQM3C，在NHQM的spacer 中添加了三個亞甲基。實驗結(jié)果表明，NHQM和NHQM3C用小分子交聯(lián)劑將自然殘基的靶標庫擴大到9個親核殘基。為了使細胞內(nèi)的交聯(lián)成為可能，還設(shè)計了一個具有同功能的交聯(lián)劑HoQM，在兩端都采用了光保護的o-QM。將NHS酯替換為光保護的QM可以在光前交聯(lián)劑的化學(xué)反應(yīng)性，從而使其進入細胞而不會引起細胞性。此外，兩端的QM可以增加交聯(lián)類型的多樣性，因為QM與NHS酯相比會和更多的殘基反應(yīng)。

與DNA交聯(lián)的試劑仍然很少，因為大多數(shù)交聯(lián)劑的反應(yīng)更傾向于蛋白-蛋白而不是蛋白-DNA交聯(lián)。甲醛是主要的試劑交聯(lián)試劑，但只能和在2埃以內(nèi)的蛋白發(fā)生交聯(lián)。QM能地烷基化脫氧核苷，因此，推斷NHQM應(yīng)該能夠使與DNA交聯(lián)，實驗證明假設(shè)是正確的。

總之，這些PQM交聯(lián)劑的光活化和多靶點反應(yīng)性將大大-、- DNA網(wǎng)絡(luò)研究和結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究的化學(xué)交聯(lián)基礎(chǔ)。

產(chǎn)品供應(yīng)列表：

BMCC-Biotin

HPDP-Biotin 

Iodoacetyl-LC-Biotin 

Iodoacetyl-PEG2-Biotin

Maleimide PEG11-Biotin

Maleimide PEG2-Biotin

Amine-PEG3-Biotin

Amine-PEG11-Biotin

Pentylamine-Biotin

Sulfo-NHS-LC-Biotin

NHS-Biotin

NHS-LC-Biotin

NHS-LC-LC-Biotin

NHS-PEG12-Biotin

NHS-SS-Biotin
NHS-SS-PEG4-Biotin
PFP-Biotin
Sulfo-NHS-LC-LC-Biotin
TFP-PEG3-Biotin
Alkoxyamine-PEG12-Biotin
Alkoxyamine-PEG4-Biotin
Alkoxyamine-PEG4-SS-PEG4-Biotin
Hydrazide-Biocytin
Hydrazide-Biotin
Biotin-LC-Hydrazide
Hydrazide-PEG4-Biotin
Psoralen-PEG3-Biotin
TFPA-PEG3-Biotin
Photoactivatable Biotin
NHS-Desthiobiotin
Sulfo-NHS-LC-Desthiobiotin
Amine-PEG4-Desthiobiotin
Hydrazide-PEG4-Desthiobiotin 

Sulfo-SHPP

上述產(chǎn)品用于科研，不可用于人體實驗！

小編：wyf 2020.10.29