ACP核酸檢測試劑盒說明書
本試劑盒選取一對鸚鵡熱衣原體(ACP)特異性引物和一條特異性熒光探針,應(yīng)用堿裂解法提取DNA,后者在耐熱DNA聚合酶(Taq酶)作用下,配以FQ-Buffer(內(nèi)含Mg2+、Tris-HCl等)、四種核苷酸單體(dNTPs)等成分,通過PCR-熒光探針體外擴增法對鸚鵡熱衣原體(ACP)一段高保守區(qū)域進行擴增,從而達到快速實時定量檢測之目的。
核酸提取液B 4管 500μl/管 ,Taq 酶系 1管 80μl/管 ,ACP–PCR MIX 1管 960μl/管 ,ACP 陽性質(zhì)控品 1管 50μl/管(1×10P7PCopies/ml)
陰性質(zhì)控品 1管 500μl/管
C-33A細胞,C8166細胞,C918細胞 適用標本:疑似患者痰液或灌洗液及咽試子等和疑似動物(鳥類及牛羊等哺乳類)肺臟、淋巴結(jié)等組織。
標本采集:
痰液:取受檢者深部痰液2-3ml置入5ml離心管,密閉送檢。
灌洗液:取待檢者肺灌洗2-3ml,置于5ml離心管,密閉送檢。
咽試子:受檢者生理鹽水漱口,無菌咽試子粘取深部痰液,置入5ml離心管,密閉送檢。
疑似動物組織:取發(fā)病動物肺臟、淋巴結(jié)等組織1g左右,轉(zhuǎn)至一1.5ml 離心管中,密閉送檢。
使用方法
DNA提取
C-33A細胞,C8166細胞,C918細胞 標本預(yù)處理
痰液或灌洗液:將痰液或灌洗液充分混勻,取0.5ml轉(zhuǎn)至1.5ml干凈離心管,加入等體積4%NaOH,充分混勻,室溫放置10min,13,000rpm離心5分鐘,棄上清,保留沉淀。咽試子:取1ml生理鹽水加入5ml離心管,充分洗滌咽試子,將洗滌液轉(zhuǎn)至1.5ml干凈離心管中,13,000rpm離心5分鐘,棄上清,保留沉淀。組織:取約100mg組織加1ml生理鹽水,研磨成組織勻漿,取50μl勻漿液轉(zhuǎn)至一潔凈的1.5ml離心管中。
DNA提?。合蛏鲜鰳吮局屑尤?0μl核酸提取液B充分混勻,100℃烈解10min。13,000rpm 離心3min,取上清液4μl做PCR反應(yīng)。C-33A細胞,C8166細胞,C918細胞
陰性質(zhì)控品:取50 μl陰性質(zhì)控品加入50μl核酸提取液B,充分震蕩。后100℃裂解10分鐘,然后13,000rpm離心3分鐘,取上清液4μl做PCR反應(yīng)。
ACP-陽性質(zhì)控品:直接取4μl進行PCR擴增?;虬凑誔CR擴增介紹方法進行定量分析。
PCR擴增
從試劑盒中取出ACP–PCR MIX、Taq酶系,室溫融化并振蕩混勻后,10,000rpm離心10s。
設(shè)所需要的PCR反應(yīng)管管數(shù)為N(N=樣本數(shù)+1管陰性對照+4管陽性對照),每個測試反應(yīng)體系配制如下表:
試劑 ACP–PCR MIX Taq酶系
用量 24μl 2μl
計算好各試劑的使用量,加入一適當體積潔凈離心管中,充分混勻,10,000rpm離心10s,向設(shè)定的N個PCR反應(yīng)管中分別加入26μl,向每管中加入處理后樣品(所獲得的DNA樣品)或ACP–陽性定量標準品(使用前用陰性質(zhì)控品梯度稀釋10倍、100倍、1000倍,記為1×10P6PCopies/ml,1×10P5PCopies/ml,1×10P4PCopies/ml)和陰性質(zhì)控品4μl,10,000rpm瞬時離心30秒。將各反應(yīng)管放入定量PCR儀器的反應(yīng)槽內(nèi),按對應(yīng)順序設(shè)置陰性控品,陽性定量標準品以及未知標本,并設(shè)置反應(yīng)體積(30μl)、樣品名稱、標記熒光基團種類(報告基團為FAM,淬滅基團為TAMRA)和循環(huán)條件:
ABI PRISM 7700,ABI PRISM5700,ABI GeneAmp 7000 (需要剪掉反應(yīng)蓋),ABI PRISM7300/7500(使用8聯(lián)管),MJ Opticon(使用8聯(lián)管)等使用薄壁管的儀器:循環(huán)條件:94→2分鐘,后93℃ 30秒→55℃ 45秒, 40個循環(huán)。
LightCycler等使用毛細管的儀器,循環(huán)條件:94→2分鐘,后93℃ 5秒→56℃ 45秒,共40個循環(huán)。
3.結(jié)果分析判定
反應(yīng)結(jié)束后保存檢測數(shù)據(jù)文件。根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié)baseline的start值(3~8),stop值(13~18)以及Threshold值,使Std curve 窗口下的標準曲線達到*(correlation數(shù)值介于-0.97~-1之間,correlation數(shù)值等同于∣r∣值),zui后到Reporter窗口下記錄儀器自動分析計算出的未知標本數(shù)值(Qty-Copies/ml)。
1301細胞,22Rv1細胞,293細胞,293Ad5細胞,293 Cells細胞,293T細胞,293T/17細胞,2BS細胞,5637(HTB-9)細胞,6T-CEM細胞,769-P細胞,786-O細胞,95-D細胞,A172細胞,A-204細胞,A2780細胞,A3細胞,A-375細胞,A-427細胞,A-431細胞,A498細胞,A549細胞,A-673細胞,A875 LIFE細胞,AAV-293細胞,ACC-2細胞,ACC-3細胞,ACHN細胞,AE1201細胞,AGS細胞,AN3CA細胞,Anglne細胞,AsPC-1細胞,Bcap-37細胞,BE(2)-M17細胞,BEAS-2B細胞,BEL-7402細胞,BEL-7404細胞,BEL-7405細胞,BeWo細胞,BGC-823細胞,BIU-87細胞,BT-325細胞,BT-474細胞,BT-549細胞,BxPC-3細胞,,Ca Ski細胞,CA46細胞,Caco-2細胞,Caki-1細胞,Calu-3細胞,Calu-6細胞,Caov-3細胞,CCC-ESF-1細胞,CCC-HB-2細胞,CCC-HBE-2細胞,CCC-HEH-細胞,CCC-HEK-1細胞,CCC-HIE-2細胞,CCC-HPE-2細胞,CCC-HPF-1細胞,CCC-HSM-2細胞,CCD-1095Sk細胞,CCRF-CEM細胞,CFPAC-1細胞,CGM1細胞,Chang liver細胞,CNE細胞,CNE-2Z細胞,CNLMG-B5537LC細胞,CNLMG-B5537SKIN細胞
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