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中級(jí)會(huì)員 | 第12年

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PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物出現(xiàn)多條帶(雜帶)解決方法

時(shí)間:2022-9-16閱讀:3328
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  擴(kuò)增產(chǎn)物出現(xiàn)多條帶(雜帶)

  1) 引物用量偏大,引物的特異性不高。

  應(yīng)調(diào)換引物或降低引物的使用量。

  2) 循環(huán)的次數(shù)過多。

  適當(dāng)增加模板的量,減少循環(huán)次數(shù)。

  3) 酶的用量偏高或酶的質(zhì)量不好。

  應(yīng)降低酶量或調(diào)換另一來源的酶。

  4) 退火溫度偏低,退火及延伸時(shí)間偏長(zhǎng)。

  應(yīng)提高退火溫度,減少變性與延伸時(shí)間,也可采用二種溫度的PCR擴(kuò)增。以2度為梯度設(shè)計(jì)梯度PCR反應(yīng)優(yōu)化退火溫度。

  5) 樣品處理不當(dāng)。

  6) Mg2+濃度偏高。

  因適當(dāng)調(diào)整Mg2+使用濃度。

  7) 若為PCR試劑盒。

  也可能時(shí)試劑盒本身質(zhì)量有問題。

  8) 復(fù)制提前終止。

  使用非熱啟動(dòng)的聚合酶時(shí)常有發(fā)生。冰上準(zhǔn)備反應(yīng)體系或采用熱啟動(dòng)聚合酶。

  9) 反應(yīng)緩沖液未*融化或未充分混勻。

  確保反應(yīng)緩沖液融化*并*混勻。

  10) 引物特異性差。

  利用BLAST檢查引物特異性或重新設(shè)計(jì)引物。

  11) 引物量過多。

  減少反應(yīng)體系中引物的用量。

  12) 模板量過多。

  質(zhì)粒DNA的用量應(yīng)<50ng,而基因組DNA則應(yīng)<200ng。

  13) 外源DNA污染。

  確保操作的潔凈。

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