盡管真核細(xì)胞用RNA干涉抵御轉(zhuǎn)座子和病原體，它們也利用這個(gè)方法來(lái)調(diào)節(jié)自身基因的表達(dá)。zui近的一篇文章發(fā)現(xiàn)了RNA干涉在控制內(nèi)源基因表達(dá)的新例子，揭示了一個(gè)新的負(fù)調(diào)節(jié)機(jī)制。生物信息學(xué)分析表明，在脊椎動(dòng)物中RNA干涉的目標(biāo)基因可能有數(shù)千個(gè)。

微小rna(micrornAs;miRNAs), 短干涉RNA(short interfering RNAs;siRNAs), 和重復(fù)序列關(guān)聯(lián)的短干涉RNA(repeat-associated siRNAs ;rasiRNAs)調(diào)節(jié)著內(nèi)源基因的表達(dá)，它們生物合成的一些特點(diǎn)如圖所示。對(duì)于siRNAs和rasiRNAs，雙鏈結(jié)構(gòu)可能由染色體基因座的雙向轉(zhuǎn)錄引起;也可能是單向轉(zhuǎn)錄后，再由RNA依賴的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase;RdRP)處理，這兩種情況是具有生物體和細(xì)胞特異性的。RNAs有非常不同的沉默結(jié)果(如圖中底部的箭頭所示)。實(shí)線表明已經(jīng)確證的過(guò)程，虛線表明沒有直接實(shí)驗(yàn)證實(shí)，只有間接的實(shí)驗(yàn)證實(shí)，