由于在一些生物中RNAi的影響格外顯著，有人提出在RNAi 途徑中可能存在某個(gè)(信號(hào))擴(kuò)增的步驟。這種擴(kuò)增可能是復(fù)制外源注入的dsRNA從而產(chǎn)生更多的sirna ，也可能是直接擴(kuò)增siRNA本身。這種擴(kuò)增可能在RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合物(RISC)形成過程進(jìn)行，作為RISC形成的補(bǔ)充，或者獨(dú)立于RISC 。

在線蟲中，較少數(shù)量的dsRNA卻能使大量的靶mrna沉默，這種現(xiàn)象的產(chǎn)生至少包含三種擴(kuò)增放大機(jī)制：

1) 長(zhǎng)的dsRNA被DICEr酶裂解成的每個(gè) siRNA (又叫初級(jí)siRNA)，都具有結(jié)合一個(gè)同源mRNA的能力，故放大水平取決于dsRNA的長(zhǎng)度。此步放大效應(yīng)約10-20倍。

2)在細(xì)胞內(nèi)還存在有一種RNA依賴的RNA聚合酶(RNA-directed RNA polymerase,RdRP)。在RISC復(fù)合物中，以siRNA的單鏈作為引物，以mRNA為模板，在RdRP酶的作用下，合成出mRNA的互補(bǔ)鏈，發(fā)生了類似于PCR的反應(yīng)，結(jié)果mRNA也形成了dsRNA。隨后dsRNA再被Dicer酶裂解成新的siRNA(又叫次級(jí)siRNA)。通過這種聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)，細(xì)胞內(nèi)的siRNA數(shù)量大大增加，顯著增強(qiáng)了對(duì)基因表達(dá)的抑制作用。

3)以上生成的siRNA可多次重復(fù)應(yīng)用，進(jìn)一步提高了其放大作用。

從21-23個(gè)核苷酸的siRNA到幾百核苷酸的雙鏈RNA都能誘發(fā)RNAi，顯然，長(zhǎng)的雙鏈RNA阻斷基因的效果要明顯強(qiáng)于短的雙鏈RNA即siRNA。