所謂超級(jí)細(xì)菌，就是那些生長(zhǎng)繁殖不受特定抗生素抑制的特殊細(xì)菌，這些細(xì)菌中要么含有某種抗生素抗性基因編碼質(zhì)粒，如*抗性*（MRSA）的NDM-1以及碳青霉烯抗性腸桿菌科細(xì)菌（CRE），要么攜帶某種抗生素抗性突變基因，如喹諾啉（沙星類(lèi)）抗性的出血性大腸桿菌SHV-18基因。
對(duì)于上述超級(jí)細(xì)菌，zui有效的抑殺方式是避免使用同類(lèi)抗生素，而換用其他抗生素。他們不用任何抗生素，而是以細(xì)菌的天敵——噬菌體來(lái)絞殺超級(jí)細(xì)菌，這正如農(nóng)業(yè)上利用白僵菌防治玉米螟那樣。噬菌體可殺死超級(jí)細(xì)菌
細(xì)菌中普遍存在“成簇規(guī)律間隔的短回文重復(fù)”（CRISPR）編輯系統(tǒng)，可以用來(lái)抵御噬菌體的入侵和寄生，因而被形象地稱(chēng)為細(xì)菌的“免疫系統(tǒng)”。由于CRISPR與噬菌體DNA同源，因而可以互補(bǔ)配對(duì)，從而被細(xì)菌的“*”——Cas9蛋白識(shí)別并被切割，結(jié)果使噬菌體不能感染細(xì)菌。
為了利用CRISPR-Cas9系統(tǒng)，研究人員設(shè)計(jì)了兩種載運(yùn)體，一種是攜帶CRISPR質(zhì)粒的基因工程細(xì)菌，還有一個(gè)是可以感染細(xì)菌并注入CRISPR的噬菌體顆粒。當(dāng)他們把兩種運(yùn)載體分別導(dǎo)入含NDM-1基因的超級(jí)細(xì)菌后，可以通過(guò)堿基互補(bǔ)找到NDM-1基因所在的未知，從而讓細(xì)菌的Cas9切割NDM-1基因，結(jié)果發(fā)現(xiàn)該法殺菌率高達(dá)99%！噬菌體可殺死超級(jí)細(xì)菌
這個(gè)方法并不是讓天然噬菌體來(lái)殺死細(xì)菌，而是利用細(xì)菌抑制噬菌體感染的原理讓細(xì)菌“自殺”，只不過(guò)是利用基因工程細(xì)菌和噬菌體把CRISPR引入到部分菌體中，并傳播至整個(gè)細(xì)菌群體。目前已在大蠟螟中完成了活體殺菌試驗(yàn)，下一步將在小鼠中評(píng)價(jià)其殺菌效果。不過(guò)，這種技術(shù)何時(shí)用于人體還有待時(shí)日，可能的方式是通過(guò)益生菌引入腸道。
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