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德國(guó)科學(xué)家利用超級(jí)計(jì)算機(jī)輔助治療癌癥

閱讀：162發(fā)布時(shí)間：2013-7-30

德國(guó)科學(xué)家利用超級(jí)計(jì)算機(jī)輔助治療癌癥
 一直以來(lái)，腫瘤學(xué)家們都希望，根據(jù)對(duì)組織切片的分析，預(yù)測(cè)一個(gè)腫瘤朝哪個(gè)方向發(fā)生突變，以便對(duì)癥下藥進(jìn)行治療。

德國(guó)柏林沙利特醫(yī)院分子腫瘤病理學(xué)實(shí)驗(yàn)室利用波茨坦大學(xué)哈索-普拉特納研究所（HPI） 正式投入運(yùn)行的新型超級(jí)計(jì)算機(jī)進(jìn)行癌癥病人基因組測(cè)序，進(jìn)行基因分析，針對(duì)病人量體裁衣建立治療模型。這一超級(jí)計(jì)算機(jī)擁有1500個(gè)平行計(jì)算的CPU，內(nèi)存30太字節(jié)（1012），外存200太字節(jié)。與常規(guī)的系統(tǒng)不同，待處理的數(shù)據(jù)不是放在硬盤(pán)上，而是在計(jì)算過(guò)程中全部放在內(nèi)存上。這臺(tái)超級(jí)計(jì)算機(jī)有2太字節(jié)的內(nèi)存專門(mén)用于存放數(shù)據(jù)，因此可采用全新的內(nèi)存數(shù)據(jù)庫(kù)技術(shù)（In-Memory），使得數(shù)據(jù)處理速度提高了一千倍，這種類型的計(jì)算機(jī)目前世界上才只有三臺(tái)。

以往，沙利特醫(yī)院分子腫瘤病理學(xué)實(shí)驗(yàn)室委托院外企業(yè)做病人基因組測(cè)序，公司保證在90天內(nèi)提交結(jié)果。用這臺(tái)計(jì)算機(jī)，在未來(lái)作基因分析幾分鐘也許甚至幾秒鐘就可完成。這樣就可大大縮短從做出診斷到開(kāi)始治療的時(shí)間，一旦做出診斷，緊跟著就能制定出治療方案，從而也大大減少了腫瘤發(fā)生變化對(duì)療效的影響，使治療方案更。
 


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