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顯微切割少量胃癌細胞中PSCA基因的分析

閱讀:254發(fā)布時間:2014-8-26

     隨著基因組關(guān)聯(lián)分析方法的應(yīng)用,越來越多與胃癌相關(guān)的易感基因被發(fā)現(xiàn),易感基因的多態(tài)性檢測已逐步進入胃癌臨床診斷和研究。然而,利用少量胃粘膜細胞開展單核苷酸多態(tài)性(SNP)分析對胃癌進行早期診斷常遇下述困難,一是少量胃癌細胞混雜在多種細胞中,異常信號常易被淹沒,二是細胞量極少,因此獲得的基因組DNA量微,進行多位點或全基因組分析存在困難。

    本文利用激光顯微切割技術(shù)分選少量胃癌細胞,結(jié)合全基因組放大技術(shù),進行胃癌相關(guān)的前列腺干細胞抗原基因(PSCA)的SNP分析。通過聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)和克隆測序方法分析,在分選的胃癌細胞中檢測到PSCA的rs2976392位點胃癌相關(guān)的“A”等位與rs2294008位點胃癌相關(guān)的“T”等位。研究結(jié)果表明,所采用的全基因組放大方法保真性高,經(jīng)過分選的胃癌細胞中SNP位點的檢測靈敏度和可靠性大為提高。所建立的少量細胞基因多位點檢測方法將同樣應(yīng)用于其它腫瘤和組織的少量細胞研究中,全基因組放大產(chǎn)物也可進行高通量的基因芯片和第二代測序研究。


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