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T細(xì)胞受體基因

閱讀:349發(fā)布時(shí)間:2013-5-7

T細(xì)胞受體基因
TCR基因的結(jié)構(gòu)和重排與Ig基因有許多相似之處。在胚系中,編碼TCR多肽鏈的DNA是由幾個(gè)分隔開(kāi)的DNA組成,在胸腺細(xì)胞中重排后,形成編碼一條完整多肽的基因。TCR多肽鏈可變區(qū)基因是由2~4個(gè)基因片段通過(guò)重排連接在一起。V基因片段編碼信號(hào)序列和可變區(qū)氨基端95~100個(gè)氨基酸殘基;J基因片段編碼可變區(qū)羧基端13~23個(gè)氨基酸殘基。TCRβ、δ鏈V區(qū)基因除V、J基因片段外,還有1~2個(gè)D基因片段,編碼V與J之間數(shù)個(gè)氨基酸殘基。TCR不同多肽鏈可變區(qū)基因的重排可有V-J、V-D-J或V-D-D-J等幾種方式。TCR多肽鏈C基因片段通常由3~4個(gè)外顯子所組成,位于J基因片段的下游。與IgC基因片段不同,TCr C基因片段是由數(shù)個(gè)外顯子編碼一個(gè)結(jié)構(gòu)域,如β鏈的連接肽(connecting peptide)是由3個(gè)分隔的外顯子所編碼。

  (一)TCRα鏈基因

  TCRα鏈基因與TCRβ鏈和Ig基因結(jié)構(gòu)有很大差別。小鼠α鏈V基因約100個(gè),至少可分為12個(gè)家族。人Vα大約在100個(gè)左右,長(zhǎng)約數(shù)百個(gè)kb。TCRα基因沒(méi)有Dα基因片段。人和小鼠α鏈基因都含有J基因片段(Jα),小鼠約有60個(gè),相互間隔至少500bp。VαJα連接具有多樣性。TCRα鏈基因只有1個(gè)Cα基因片段,含有4個(gè)外顯子。在TCRα鏈基因座中有TCRδ鏈基因。TCRα鏈基因重組信號(hào)中長(zhǎng)的間隔序列(23bp)3′端靠近Vα,短的間隔序列(12bp)的5′端靠近Jα,這種重組信號(hào)的排列方式類(lèi)似Ig輕鏈V區(qū)的基因,允許Vα基因直接與Jα基因重排,而不需要VD基因片段。

 ?。ǘ㏕CRβ鏈基因

  小鼠胚系中未重排的β鏈基因結(jié)構(gòu)已經(jīng)搞清,長(zhǎng)約數(shù)百kb。Vβ基因數(shù)目約30個(gè),大多數(shù)Vβ基因片段位于Cβ1的上游,至少有1個(gè)Vβ(Vβ14)在Cβ2基因3′下游10kb處,與轉(zhuǎn)錄的方向相反。人Vβ基因片段約有100個(gè)。小鼠和人都有2個(gè)Dβ基因片段,12~14bp長(zhǎng),分別位于Jβ1和Jβ2基因片段組上游約500~600bp處。小鼠和人都有2組(cluster)Jβ基因片段,稱(chēng)為Jβ1和Jβ2,與相應(yīng)的Cβ1和Cβ2基因片段間隔2~3kb。小鼠Jβ1和Jβ2各含7個(gè)Jβ基因片段,其中6個(gè)有功能,Jβ基因片段相互間隔36~421bp。人Jβ1和Jβ2各含7個(gè)有功能的Jβ基因片段。人和鼠TCRβ基因都有2個(gè)基本相同的Cβ基因片段,各含4個(gè)外顯子。Cβ1和Cβ2高度同源,2個(gè)Cβ基因片段的編碼產(chǎn)物中只有4個(gè)氨基酸殘基(小鼠)或5個(gè)氨基酸(人)不同。

  TCRα和β鏈V基因編碼區(qū)域包括了相當(dāng)于Ig的CDR1和CDR2,主要是識(shí)別MHC分子和抗原的復(fù)合物。CDR3主要是由于V-D-J或V-D-D-J連接的多樣性(junctional diversity)和廣泛分布的N核苷酸插入(N nucleotide insertion)所造成,其有高度的多樣性,可識(shí)別眾多種類(lèi)的抗原。

 

圖3-15 小鼠TCR基因的結(jié)構(gòu)

 ?。ㄈ㏕CRγ鏈基因

  Vγ基因片段數(shù)較少,在Balb/c小鼠Vγ基因片段有7個(gè),分為5個(gè)家族,其中4個(gè)家族各只含1個(gè)Vγ,另一家族有3個(gè)Vγ。人Vγ有14個(gè),其中8個(gè)是有功能的。人和小鼠TCRγ鏈基因均不含D基因片段。在小鼠,有4個(gè)Jγ基因片段,基中Jγ1、Jγ3和Jγ4分別位于3個(gè)Cγ基因片段的上游,Jγ3為假基因。在人類(lèi)共有5個(gè)Jγ基因片段,可分為Jγ1和Jγ2兩組,其中Jγ1的3個(gè)片段位于Cγ1上游,Jγ2的2個(gè)片段位于Cγ2基因片段的上游。不鼠有4個(gè)Cγ基因片段,其中Cγ3是假基因。人有2個(gè)Cγ基因片段,相距約10kb,其中1個(gè)Cγ有3個(gè)外顯子,另一個(gè)Cγ含有4個(gè)或5個(gè)外顯子。編碼γ鏈連接肽部分的兩個(gè)Cγ基因外顯子組成存在著差異,有一個(gè)Cγ基因片段不編碼半*,因此造成了TCRγ鏈在分子量、N-連接糖基化的形式以及是否與TCRδ鏈之間形成二硫鍵有所不同。

 

圖3-16 人TCR基因的結(jié)構(gòu)

 ?。ㄋ模㏕CRδ鏈基因

  人和小鼠TCr δ鏈基因結(jié)構(gòu)十分相似,均位于α鏈基因座內(nèi)。在Balb/c小鼠,Vδ基因片段數(shù)約為8個(gè)。在小鼠δ鏈基因中有2個(gè)Dδ、2個(gè)Jδ和1個(gè)Cδ基因。在胸腺細(xì)胞分化過(guò)程中,δ鏈先于α鏈表達(dá)。Vα與Jα重排可導(dǎo)致δ基因復(fù)合物中D、J和C基因片段的缺失。在人δ鏈基因中有8個(gè)Vδ基因片段,2個(gè)Dδ、3個(gè)Jδ和1個(gè)Cδ。某些Vδ基因片段是與TCRα鏈Vα基因共用的。

  TCRδ鏈基因連接信號(hào)的排列方式是:每個(gè)Vδ基因片段的3′端緊靠著“七聚體-長(zhǎng)間隔序列-九聚體”(7-23-9)結(jié)構(gòu);Dδ基因片段5′端是“九聚體-短間隔序列-七聚體(9-12-7)結(jié)構(gòu),3′端是“7-23-9”結(jié)構(gòu);2個(gè)Jδ基因片段的5′端是“9-12-7”結(jié)構(gòu)。這種TCRδ鏈基因重組信號(hào)排列的方式使得V、D、J鏈接可有以下幾種不同方式:(1)V-D-J連接,在小鼠胚胎TCRγδ胸腺細(xì)胞zui常見(jiàn)到Vδ-Dδ2-Jδ的連接,人胚胎胸腺細(xì)胞zui常見(jiàn)到Vδ-Dδ3-Jδ;(2)V-J的直接連接;(3)大多數(shù)成年小鼠TCRγδ胸腺細(xì)胞以Vδ-Dδ1-Dδ2-Jδ連接,人妊娠后期胎兒TCRγδ胸腺細(xì)胞也存在著Vδ-Dδ1-Dδ2-Jδ的排列方式。Vδ基因位于Vα基因之中,同一個(gè)V基因片段可用作Vδ或Vα,如果V基因片段是用作Vδ,多發(fā)生V-D(-D)-J重排。

  小鼠TCRγδ T細(xì)胞γ和δ鏈配對(duì)的,Vδ1幾乎總是和Vγ5或Vγ6配對(duì)。小鼠TCRγδ陽(yáng)性樹(shù)突狀表皮細(xì)胞(DEC)幾乎都是Vγ5與Vδ1配對(duì)。在人Vδ2幾乎總是與Vγ9配對(duì)。

T細(xì)胞受體基因


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