到目前為止，生物學家仍然還不清楚，人類和其他生物體內(nèi)到底有多少個編碼蛋白質(zhì)的活性基因，即便一些物種的基因組已經(jīng)完成了序列測定。只是因為許多基因和它們的蛋白質(zhì)產(chǎn)物是通過計算機程序預(yù)測出來的。
蛋白質(zhì)組學領(lǐng)域的目標是發(fā)現(xiàn)所有由一個特定生物產(chǎn)生的蛋白質(zhì)。這樣的蛋白質(zhì)組圖譜將可能推測出的活性基因數(shù)量和在基因組中的定位。這個工作要比只是簡單測序基因組要復(fù)雜的多，因為它的內(nèi)容包括鑒定出包括那些含量甚微的蛋白質(zhì)在內(nèi)的所有蛋白質(zhì)。
但是，由歐洲科學基金會支持的一個新的研究機構(gòu)預(yù)測說，目前已經(jīng)可以確定出至少一個生物的完整的蛋白質(zhì)組。這樣的廣泛的圖譜將成為開放并zui終廣泛應(yīng)用新一代蛋白質(zhì)學技術(shù)奠定重要的基礎(chǔ)。這些*技術(shù)順次又會極大地促進人們對許多疾病的了解并有助于開發(fā)出新的治療藥物。
包括癌癥和許多致病性感染在內(nèi)的大多數(shù)疾病都與細胞或組織中與大量蛋白質(zhì)及其相互作用變化有關(guān)的調(diào)節(jié)過程的破壞。瑞士分子細胞生物學研究所、歐洲科學基金會workshop的Rudolf Aebersold教授表示，如果我們能確定出整個蛋白質(zhì)組，那么就可以發(fā)明出能夠更快、更便宜分析蛋白質(zhì)的工具。然后，就可能確定出與特定的疾病有關(guān)的蛋白質(zhì)，從而幫助研究人員了解病因并zui終能夠進行疾病的診斷。
導(dǎo)致這種結(jié)果的一個zui簡單的解釋就是由于缺少靈敏的蛋白質(zhì)組學方法。但是，隨著蛋白質(zhì)組學方法靈敏性的提高，這種解釋越來越不可能。另一個可能就是確實有那么多的基因。Aebersold希望這個workshop將能夠領(lǐng)導(dǎo)一項歐盟資助的關(guān)鍵項目以確定出完整的蛋白質(zhì)組、回答這些問題并更地算出人類和其他生物體中到底有多少個基因。
Aebersold指出，蛋白質(zhì)組學的zui大獎將是發(fā)明一種更簡單、有效地確定出樣本中的個體蛋白的技術(shù)，從而能夠用于研究和整個生物技術(shù)和醫(yī)藥領(lǐng)域。歐洲科學基金會workshop已經(jīng)準備構(gòu)建歐洲的合作框架來參與大型的蛋白質(zhì)組學計劃。
人類基因組計劃
人類基因組計劃（human genome project, HGP）是由美國科學家于1985年提出，于1990年正式啟動的。美國、英國、法蘭西共和國、德意志聯(lián)邦共和國、日本和我國科學家共同參與了這一價值達30億美元的人類基因組計劃。這一計劃旨在為30多億個堿基對構(gòu)成的人類基因組測序，發(fā)現(xiàn)所有人類基因并搞清其在染色體上的位置，破譯人類全部遺傳信息。與曼哈頓 計劃和阿波羅計劃并稱為三大科學計劃。
基因組就是一個物種中所有基因的整體組成。人類基因組有兩層意義：遺傳信息和遺傳物質(zhì)。要揭開生命的奧秘，就需要從整體水平研究基因的存在、基因的結(jié)構(gòu)與功能、基因之間的相互關(guān)系。HGP的目的是解碼生命、了解生命的起源、了解生命體生長發(fā)育的規(guī)律、認識種屬之間和個體之間存在差異的起因、認識疾病產(chǎn)生的機制以及長壽與衰老等生命現(xiàn)象、為疾病的診治提供科學依據(jù)。
確定蛋白質(zhì)組將有助于一個更新的生物學謎團，即為什么所有生物都含有比實際可檢測到的蛋白質(zhì)更多數(shù)量的預(yù)測出的蛋白質(zhì)編碼基因。這種落差在所有生物中都很顯著，即通過基因組分析預(yù)測到的蛋白質(zhì)只有實際蛋白質(zhì)的65％。之所以令人驚訝是因為，一般認為每個基因都只能一對一地編碼蛋白質(zhì)。
