6月15日，Genes & Development雜志發(fā)表了中科院生物物理研究所劉迎芳實驗室和北京生命科學(xué)研究所（NIBS）王曉晨實驗室的合作研究成果——Structural Study of TTR-52 Reveals the Functional Mechanisms of a Bridging Molecule in Apoptotic Cell Engulfment。該工作通過結(jié)構(gòu)和功能研究，揭示了在秀麗線蟲凋亡細胞的清除過程中，橋聯(lián)分子TTR-52介導(dǎo)吞噬細胞識別凋亡細胞的作用機制。
細胞凋亡后需要被及時清除以維持機體平衡。在線蟲中，TTR-52是一個介導(dǎo)凋亡細胞和吞噬細胞的橋聯(lián)分子，通過識別凋亡細胞上外翻的磷脂酰*（ PS ）來識別凋亡細胞，同時TTR-52也可以結(jié)合吞噬細胞上的受體CED-1，進而介導(dǎo)凋亡細胞的吞噬。從序列分析來看，TTR-52類似于transthyretin，一種甲狀腺激素結(jié)合蛋白。但是過去報道的transthyretin都不具有這種介導(dǎo)凋亡細胞吞噬的功能。為了研究TTR-52的分子機制，研究人員希望得到TTR-52的晶體結(jié)構(gòu)。在研究初期，重組表達的TTR-52蛋白非常容易聚集成不均一的高聚體，這給結(jié)晶工作帶來很大的困擾。通過Alanine scanning方法篩選大量的突變體，研究人員zui終發(fā)現(xiàn)一個突變體可以形成少量穩(wěn)定的二聚體，經(jīng)過晶體篩選，zui終解析了這個突變體的晶體結(jié)構(gòu)。并以此突變體為依據(jù)，構(gòu)建了野生型蛋白的結(jié)構(gòu)模型，并進行了功能分析和實驗印證。
中科院生物物理所康彥勇博士、梁歡歡博士和NIBS趙東風(fēng)博士為本文的共同*作者。王曉晨博士與劉迎芳研究員為共同通訊作者。此外，其他一些人員也在研究過程中提供了幫助和建議。該項工作得到*、基金委、*及北京市政府等方面的資助。
晶體結(jié)構(gòu)顯示，TTR-52分子形成一個開放的β桶結(jié)構(gòu)，與含有8個β折疊片的β桶和β三明治結(jié)構(gòu)都不同，TTR-52由7個β折疊片組成。TTR-52的C端因為缺少一個β折疊片，造成部分疏水核心暴露，這種*的結(jié)構(gòu)特征暗示其具有生物學(xué)意義。隨后的體內(nèi)和體外實驗都證明，TTR-52利用該疏水區(qū)域與吞噬受體CED-1結(jié)合。此外，TTR-52的第二、第三個loop區(qū)域形成一個杯裝的正電區(qū)，這和transthyretin很不同，卻和其他PS結(jié)合蛋白如PKCα, TIM4具有類似之處。經(jīng)過突變實驗，研究發(fā)現(xiàn)TTR-52的這兩個loop區(qū)域可以通過陽離子介導(dǎo)PS的結(jié)合，從而識別凋亡細胞;此外，晶體結(jié)構(gòu)中還觀察到TTR-52可以形成背靠背的二體，在該二體界面上進行突變可以將二體打開，但是該單體蛋白介導(dǎo)凋亡細胞吞噬的功能大大下降，該結(jié)果暗示由二體作為基本單元可能是TTR-52發(fā)揮功能的形式。
該研究不僅揭示了線蟲細胞凋亡中TTR-52介導(dǎo)吞噬細胞識別凋亡細胞的作用機制，而且對了解其他高等生物中橋連分子介導(dǎo)的凋亡細胞吞噬機制也有一定指導(dǎo)作用。
