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南方醫(yī)科大學(xué)文章:差異表達(dá)基因解析癌癥轉(zhuǎn)移

閱讀:287發(fā)布時(shí)間:2013-11-11

 

迎來(lái)了新期刊:ELISA試劑盒科學(xué)通報(bào),中國(guó)科學(xué)C輯:生命科學(xué),這兩份期刊均是由*和*共同主辦的,我國(guó)學(xué)術(shù)期刊中的,被國(guó)內(nèi)外各主要檢索系統(tǒng)收錄,如國(guó)內(nèi)的《中國(guó)科學(xué)論文與引文數(shù)據(jù)庫(kù)》(CSTPCD)、《中國(guó)科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫(kù)》(CSCD)等;美國(guó)的SCI、CA、EI,英國(guó)的SA,日本的《科技文獻(xiàn)速報(bào)》等。目前針對(duì)每期的重點(diǎn)內(nèi)容,生物通將展開(kāi)詳細(xì)推薦,歡迎讀者共同參與……生物通報(bào)道:大腸癌是消化道常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,轉(zhuǎn)移是造成大腸癌患者死亡的首要原因,因此明確大腸癌早期轉(zhuǎn)移相關(guān)分子事件中的關(guān)鍵基因, 對(duì)大腸癌的診斷與治療均有重要意義。來(lái)自南方醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院的兩位研究人員通過(guò)大腸癌基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)篩選差異表達(dá)基因,由此分析差異表達(dá)基因在大腸癌早期轉(zhuǎn)移中所起到的關(guān)鍵作用,找到了在大腸癌轉(zhuǎn)移分子機(jī)制中可能起著重要作用的基因。
大腸癌是消化道主要的惡性腫瘤之一, 其惡性ELISA試劑盒程度高, 早期即可通過(guò)淋巴道轉(zhuǎn)移,對(duì)人體危害極大。在轉(zhuǎn)移早期腫瘤細(xì)胞會(huì)出現(xiàn)形態(tài)變化使之能夠變形、游走, 這是腫瘤轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵步驟, 因此明確腫瘤的早期轉(zhuǎn)移相關(guān)分子機(jī)制,篩選早期轉(zhuǎn)移分子事件中的關(guān)鍵基因,是抑制腫瘤轉(zhuǎn)移、研發(fā)靶向治療藥物的關(guān)鍵一步。在這篇文章中,研究人員主要通過(guò)對(duì)表達(dá)譜數(shù)據(jù)中早期轉(zhuǎn)移的大腸癌數(shù)據(jù)與正常大腸數(shù)據(jù)的差異表達(dá)基因進(jìn)行篩選,并對(duì)篩選出的基因進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)及實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證并進(jìn)行生物信息學(xué)分析, 通過(guò)表達(dá)譜數(shù)據(jù)分析差異表達(dá)基因與患者生存期、腫瘤組織的分化程度及腫瘤分期之間的關(guān)系, 并通過(guò)差異表達(dá)基因在不同物種間平均進(jìn)化距離的大小, 明確這些基因的保守程度,進(jìn)一步分析差異表達(dá)基因相互作用蛋白及相互作用蛋白所組成的網(wǎng)絡(luò)模塊, 明確差異表達(dá)基因在大腸癌轉(zhuǎn)移中所起的重要作用。
研究人員zui終篩選出了與大腸癌早期轉(zhuǎn)移相關(guān)差異表達(dá)基因共16個(gè), 其中表達(dá)上調(diào)的9個(gè)基因分別為 VSNL1, PSAT1, KIAA1199,ABHD7, MMP7, JUB, CLDN1, KRT23, FOXQ1. 表達(dá)下調(diào)的 7個(gè)基因分別為 SFRP1, SLC4A4,CHGA, GCG, GUCA2B, CLDN8, CD177。經(jīng)過(guò)分析, 與組織分化程度相關(guān)的基因有PSAT1和JUB,與腫瘤分期相關(guān)的基因有VSNL1和MMP7。而且VSNL1, PSAT1, CLDN1, SLC4A4, GCG基因在進(jìn)化過(guò)程中較為保守。
由此研究人員指出, 上調(diào)的 9個(gè)差異表達(dá)基因及下調(diào)的 7 個(gè)差異表達(dá)基因在大腸癌轉(zhuǎn)移分子機(jī)制中可能起著重要作用, 因其在大腸癌中的特異度較高,有望能夠成為聯(lián)合診斷的分子標(biāo)簽。這項(xiàng)研究通過(guò)對(duì)篩選的大腸癌早期轉(zhuǎn)移相關(guān)的關(guān)鍵基因的分析, 明確了ELISA試劑盒關(guān)鍵基因在大腸癌轉(zhuǎn)移中所起的重要作用,并進(jìn)一步驗(yàn)證了差異表達(dá)基因在大腸癌中的特異性, 這些關(guān)鍵基因?qū)μ峁┐竽c癌轉(zhuǎn)移相關(guān)藥物治療靶點(diǎn)及大腸癌早期轉(zhuǎn)移分子診斷有重要的指導(dǎo)意義。

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