Mayo診所病理學(xué)家Andrew Feldman博士在Illumina GAIIx, HiSeq測序平臺(tái)上，對(duì)外周T細(xì)胞淋巴瘤進(jìn)行了全基因組測序分析，在多發(fā)性外周T細(xì)胞淋巴瘤中發(fā)現(xiàn)了13個(gè)基因組異常。其中的5個(gè)與重要的p53蛋白的合成及其活性有關(guān)，由于p53蛋白在細(xì)胞周期中的核心作用及其抑癌能力，它常被稱為“基因組的保衛(wèi)者”。

該文章提前發(fā)表在8月1日Blood雜志的網(wǎng)絡(luò)版上。

“每當(dāng)我診斷出一例外周T細(xì)胞淋巴瘤，我都會(huì)想到有三分之二的患者會(huì)被這一疾病擊敗，”Feldman博士說。“這種感覺非常糟糕，而我希望這項(xiàng)研究能改變這一狀況。”

外周T細(xì)胞淋巴瘤PTCL是成熟T淋巴細(xì)胞惡性腫瘤，約有12%的non-Hodgkin’s淋巴瘤是外周T細(xì)胞淋巴瘤，這種疾病的而死亡率非常高。在診斷出該疾病后，只有少于35%的患者能存活超過五年。由于人們?nèi)鄙賹?duì)外周T細(xì)胞淋巴瘤遺傳學(xué)和分子發(fā)病機(jī)理的了解，使該疾病治療缺少分子靶標(biāo)，治療效果也受到限制。

研究人員利用第二代測序技術(shù)和生物信息學(xué)工具，對(duì)16位外周T細(xì)胞淋巴瘤患者的組織樣本以及6個(gè)外周T細(xì)胞淋巴瘤細(xì)胞系進(jìn)行了全基因組測序分析。研究人員發(fā)現(xiàn)的關(guān)鍵性外周T細(xì)胞淋巴瘤基因組異常如下：

• 發(fā)現(xiàn)了13個(gè)反復(fù)發(fā)生的染色體重拍

• 發(fā)現(xiàn)了13個(gè)重排事件中有5個(gè)涉及具有重要的抑癌功能的p53基因，

• 發(fā)現(xiàn)了涉及TP53同源基因和TP63的新重排事件，新發(fā)現(xiàn)的TP63重排編碼了一個(gè)融合蛋白，一個(gè)抑制p53通路的p63異構(gòu)體。這些重排事件都與患者的存活期短有關(guān)

• 發(fā)現(xiàn)了4個(gè)染色體內(nèi)的突變，包括已知的ALK和DUSP22-IRF4異位。

該研究為特定亞型的外周T細(xì)胞淋巴瘤提供了新的生物學(xué)診斷標(biāo)記（機(jī)體系統(tǒng)中的化學(xué)或遺傳學(xué)線索），并能幫助人們開發(fā)新的治療手段。以前要取得這些進(jìn)展并不容易，因?yàn)樵陲@微鏡下顯得很相似的淋巴瘤可能實(shí)際上大為不同，使得人們難以預(yù)測其對(duì)治療的反應(yīng)。此外，科學(xué)家和醫(yī)生們對(duì)于外周T細(xì)胞淋巴瘤發(fā)育和增殖機(jī)制的了解也相當(dāng)有限。

美國Mayo診所的研究人員完成了世界上*外周T細(xì)胞淋巴瘤的全基因組測序分析，外周T細(xì)胞淋巴瘤是一種高度侵襲性的免疫系統(tǒng)癌癥，這項(xiàng)研究揭開了其背后鮮為人知的遺傳學(xué)致病因素。

“T細(xì)胞淋巴瘤zui常見的類型被稱作是‘無特殊說明’這基本就是個(gè)廢紙簍似的診斷，這是因?yàn)槲覀儗?duì)不同T細(xì)胞淋巴瘤亞型的特異性遺傳學(xué)突變還了解的不夠，而不同的亞型需要不同的治療方式，”Dr. Feldman說。

Dr. Feldman的這項(xiàng)研究將有助于改善T細(xì)胞淋巴瘤的診斷，并幫助開發(fā)有針對(duì)性的治療方法。