家蠶絲腺甲基化譜完成
研究成果“家蠶基因組甲基化譜”,這是中國科學(xué)家在家蠶基因組研究領(lǐng)域取得的又一項(xiàng)重要成果。
作為表觀遺傳學(xué)的一種重要標(biāo)記,DNA甲基化在基因組防御、基因調(diào)控等方面都發(fā)揮著重要作用。相對(duì)于動(dòng)植物,昆蟲甲基化水平很低,其功能也一直存在爭議。近年來,隨著越來越多昆蟲甲基化基因和甲基化酶的報(bào)道,昆蟲甲基化的功能和生物學(xué)意義引起了廣泛的興趣。
zui近,中國科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所王文研究員領(lǐng)導(dǎo)的馬普小組的相輝博士等,與深圳華大基因研究院、西南大學(xué)蠶桑學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室以及上海腫瘤所的朱景德研究員小組共同合作,利用新一代測序技術(shù)構(gòu)建了*張單堿基分辨率的昆蟲甲基化譜——家蠶絲腺甲基化譜。
研究發(fā)現(xiàn)大約0.11%的基因組胞嘧啶被甲基化修飾,比哺乳動(dòng)物和植物低至少50倍。甲基化區(qū)域主要富集在基因區(qū),并且與基因表達(dá)水平成正相關(guān)。動(dòng)植物中被報(bào)道發(fā)揮重要作用的啟動(dòng)子區(qū)、核糖體rDNA區(qū)甲基化調(diào)控,以及轉(zhuǎn)座子區(qū)的甲基化抑制,在昆蟲中似乎還不具備。
家蠶甲基化譜的完成不但對(duì)理解昆蟲表觀遺傳學(xué)調(diào)控的提供了重要的參考資料,也為進(jìn)一步發(fā)掘家蠶人工馴化過程中潛在的表觀遺傳學(xué)貢獻(xiàn)奠定了研究基礎(chǔ)。