建立組蛋白變異的文庫(kù)
核小體(nucleosome)是真核生物染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位,染色質(zhì)纖維的基本結(jié)構(gòu)由其串聯(lián)而成。
核小體又被稱為核體、核粒等,它包含200個(gè)左右堿基對(duì)的DNA和五種組蛋白(histone),其中四
種組蛋白兩兩組成八聚體的圓盤結(jié)構(gòu),從而構(gòu)成核小體的核心結(jié)構(gòu),核小體的結(jié)構(gòu)完整性影響著
DNA代謝以及轉(zhuǎn)錄的調(diào)節(jié)過(guò)程。
在2008年9月19日出版的《細(xì)胞》(Cell)上,來(lái)自美國(guó)約翰霍普金斯大學(xué)(Johns Hopkins
University)的Dai等科學(xué)家以封面文章的形式發(fā)表了他們的研究結(jié)果。利用一種綜合方法,
科學(xué)家建立了啤酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)組蛋白H3和H4的一個(gè)文庫(kù),文庫(kù)中組蛋白H3
和H4的代換、刪除變異能探明各自組蛋白殘基對(duì)核小體功能的作用。通過(guò)研究,科學(xué)家們探明了不
同殘基各自對(duì)染色體完整性、轉(zhuǎn)錄的貢獻(xiàn),并且得到了核小體表面化學(xué)敏感性以及轉(zhuǎn)錄沉默條件的
全面模式。
每個(gè)組蛋白變異都有一個(gè)*的分子磁條(molecular barcode),這使得通過(guò)分子磁條放大
、標(biāo)記和TAG微陣列雜交就能很容易的實(shí)現(xiàn)組蛋白變異的辨認(rèn)。分子磁條被用于記錄多種表型例如
競(jìng)爭(zhēng)適度、DNA修復(fù)熟度、以及基因相互作用等等。
以上的研究結(jié)果揭示出不同的組蛋白殘基的新功能,以及這些核小體組分及其修飾子之間的新型相
互作用。