ELISA試劑研究發(fā)布在8月5日的《自然遺傳學(xué)》(Nature Genetics)雜志上。
論文的主要作者、哥倫比亞大學(xué)醫(yī)學(xué)中心病理學(xué)和神經(jīng)病學(xué)教授Antonio Iavarone博士說(shuō):“癌癥依賴于驅(qū)動(dòng)基因(driver genes)來(lái)維持癌癥,這些驅(qū)動(dòng)基因是治療的靶點(diǎn)。"
“一旦你知道一種特定腫瘤的驅(qū)動(dòng)子,你擊中它,癌癥就會(huì)崩潰。我們認(rèn)為我們的研究已經(jīng)取得了膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中絕大多數(shù)的驅(qū)動(dòng)基因,因此為膠質(zhì)母細(xì)胞瘤藥物開(kāi)發(fā)提供了zui重要的靶點(diǎn)列表,并為腦癌個(gè)體化治療奠定了基礎(chǔ)。"
哥倫比亞大學(xué)醫(yī)學(xué)中心兒科學(xué)和病理學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)副教授Anna Lasorella博士說(shuō),對(duì)于大約15%的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者,個(gè)體化治療有可能會(huì)很快成為現(xiàn)實(shí)。
她說(shuō):“新研究顯示大約15%的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤它們的驅(qū)動(dòng)基因,都可以用目前FDA批準(zhǔn)可獲得的藥物靶向。不知道為什么這些患者在當(dāng)前的臨床試驗(yàn)中沒(méi)有接受這些藥物治療。"
新生物信息學(xué)技術(shù)將驅(qū)動(dòng)基因與其他的突變區(qū)分開(kāi)來(lái)
在所有單個(gè)腫瘤中,可能有成百上千的基因發(fā)生了突變,但將驅(qū)動(dòng)癌癥的突變與沒(méi)有影響的突變區(qū)分開(kāi)來(lái)對(duì)研究人員而言是一個(gè)長(zhǎng)期存在的挑戰(zhàn)。
該研究小組結(jié)合高通量DNA測(cè)序與一種統(tǒng)計(jì)分析新方法,生成了一個(gè)驅(qū)動(dòng)候選基因短名單。大規(guī)模分析近140個(gè)腦瘤,測(cè)序腫瘤中每個(gè)基因的DNA和RNA,鑒別出了每個(gè)腫瘤的所有突變。共同作者、生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)助理教授Raul Rabadan博士設(shè)計(jì)出一種統(tǒng)計(jì)算法,隨后被用于鑒別zui有可能的驅(qū)動(dòng)突變。不同于其他的技術(shù),這一算法不僅考慮到了不同腫瘤中基因的突變頻率,還納入了突變方式,由此將驅(qū)動(dòng)突變與其他的突變區(qū)分開(kāi)來(lái)。
Iavarone博士說(shuō):“如果腫瘤中基因的一個(gè)副本在一個(gè)單位點(diǎn)突變,第二個(gè)副本以另一種不同方式突變,那么這個(gè)基因就有較高的概率是驅(qū)動(dòng)基因。"
分析確定了15個(gè)以往在其他研究中證實(shí)的驅(qū)動(dòng)基因,還發(fā)現(xiàn)了18個(gè)從未顯示與膠質(zhì)母細(xì)胞相關(guān)的新驅(qū)動(dòng)基因。
值得注意的是,在18個(gè)新基因中有一些zui重要的候選基因,例如LZTR1和delta catenin,在來(lái)自人類腫瘤的癌癥干細(xì)胞實(shí)驗(yàn)室研究、細(xì)胞培養(yǎng)物檢測(cè)以及移植小鼠研究中均被證實(shí)是驅(qū)動(dòng)基因。