細胞凋亡過程中可觀察到系列形態(tài)學(xué)特征和生化特征。早期凋亡信號的效應(yīng)產(chǎn)生于胞內(nèi)，此時細胞膜保持完整。MERCK公司已發(fā)展出幾種方法以檢測凋亡細胞胞內(nèi)的多種效應(yīng)，包括：DNA 段的檢測、膜對稱性的變化、caspases激活、以及細胞死亡相關(guān)蛋白水平的變化等。多數(shù)檢測使用的底物和Marker適用于絕大多數(shù)種類的哺乳動物。
        凋亡細胞染色體DNA以核小體為單位的切割導(dǎo)致細胞不可逆死亡。可以采用Nucleosome ELISA試劑盒，對產(chǎn)生的單體及寡聚核DNA段進行定量。核小體的DNA成分被捕獲于酶標(biāo)板上，使用生物素標(biāo)記的抗組蛋白抗體檢測捕獲的核小體數(shù)量。組蛋白-DNA段的量反應(yīng)了一個特定樣品中死亡及瀕臨死亡的細胞的量。
        DNA段也可通過片段末端標(biāo)記進行原位檢測，MERCK提供基于TUNEL方法的ELISA試劑盒。DNA段末端標(biāo)記可通過熒光染料或比色底物方法進行檢測。另外，細胞形態(tài)的變化如胞膜皺摺或出泡、核染色質(zhì)致密、胞質(zhì)濃縮等，都可作為細胞凋亡的證據(jù)。采用熒光染料進行末端標(biāo)記的可用流式細胞技術(shù)進行定量，其光散射變化也可支持由單一參數(shù)得出的結(jié)論。DNA段可以從凋亡細胞中分離并使用瓊脂糖電泳進行分析。約180bp的多倍寡核小體片段在電泳上呈典型的梯狀條帶，可進一步證實凋亡的存在。若使用Pellet Paint Co-Precipitant，只需室溫操作，兩分鐘即幫助DNA沉淀更快捷方便。
        線粒體膜電位和膜通透性的變化也是凋亡細胞一個重要特點。凋亡細胞另一個生化特征是細胞膜內(nèi)側(cè)的磷脂酰絲氨酸從胞質(zhì)轉(zhuǎn)至胞外。膜聯(lián)蛋白中的Annexin Ⅴ，是一種磷脂結(jié)合蛋白，與磷脂酰絲氨酸有強親和力。通過使用Annexin Ⅴ-FITC（PF032）或AnnexinⅤ-Biotin Apoptosis Detection Kit，及RAPIDTM 方法進行凋亡細胞早期檢測?？墒褂昧魇郊毎麅x或熒光顯微鏡監(jiān)測。同時使用PI，ELISA試劑盒根據(jù)細胞膜的通透性區(qū)分早期凋亡細胞和壞死細胞。