ChIP：基因組學(xué)與蛋白質(zhì)組學(xué)的連接

時間：2012-11-5閱讀：820

ChIP還可與DNA芯片和測序技術(shù)相結(jié)合，用于高通量的篩選已知蛋白因子的未知DNA靶點和研究反式作用因子在整個基因組上的分布情況，這將有助于深入理解DNA-蛋白質(zhì)相互作用的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，了解一些疾病如癌癥、心血管疾病和中央神經(jīng)紊亂的發(fā)生的機制。

基因組學(xué)和蛋白組學(xué)都將把染色質(zhì)作為研究對象，但兩個領(lǐng)域采用的方法各異。在基因組學(xué)研究中，研究人員通常從一個蛋白質(zhì)開始研究，采用ChIP去找出與基因組關(guān)聯(lián)的蛋白質(zhì)。而蛋白組學(xué)研究采用的是反向方法，先用一個特殊的DNA序列作為尋找蛋白質(zhì)的誘餌；然后用ChIP去證實：那些蛋白質(zhì)就是在體內(nèi)與DNA序列相關(guān)聯(lián)的蛋白質(zhì)。

ChIP的原理很簡單，就是選擇性地富集包含某一特定抗原的染色質(zhì)片段。傳統(tǒng)的ChIP包含以下幾個步驟：甲醛處理使蛋白質(zhì)與DNA交聯(lián)；超聲波將染色質(zhì)打斷成一定大?。煌ㄟ^抗體沉淀蛋白質(zhì)－DNA交聯(lián)復(fù)合體；用蛋白酶K處理，解除交聯(lián)，純化DNA；實時定量PCR檢測DNA的量。雖然ChIP技術(shù)的原理不復(fù)雜，但是對技術(shù)的要求高，實驗步驟的設(shè)計摸索耗時耗力，實驗耗費時間長。

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