8月12日, 學(xué)術(shù)期刊Molecular and Cellular Proteomics在線發(fā)表了*上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所/系統(tǒng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室曾嶸研究組的工作：運(yùn)用陰陽多維液相色譜-質(zhì)譜系統(tǒng)和穩(wěn)定同位素標(biāo)記的方法，同步定量細(xì)胞蛋白質(zhì)組及磷酸化蛋白質(zhì)組，從而系統(tǒng)地揭示了蛋白質(zhì)磷酸化和基因表達(dá)間的關(guān)系。
磷酸化是蛋白質(zhì)zui重要的翻譯后修飾之一,磷酸化肽段和非磷酸化肽段的不同特性，使得磷酸化肽段和非磷酸化肽段的同步鑒定及定量成為蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的難點(diǎn)。生化與細(xì)胞所博士生伍一博等人在曾嶸研究員指導(dǎo)下，運(yùn)用該實(shí)驗(yàn)室發(fā)明的陰陽多維液相色譜-質(zhì)譜系統(tǒng)（Yin-Yang-MDLC-MS/MS）及在線pH梯度洗脫對(duì)細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)酶解肽段進(jìn)行分級(jí)分離，實(shí)現(xiàn)了一次實(shí)驗(yàn)中對(duì)磷酸化肽段和非磷酸化肽段的同步鑒定。該項(xiàng)工作是與吳家睿研究組和李亦學(xué)研究員領(lǐng)導(dǎo)的生物信息中心合作完成的，并得到了*，基金委和中科院經(jīng)費(fèi)支持。
進(jìn)一步結(jié)合穩(wěn)定同位素標(biāo)記 （SILAC）的方法，可以同步定量細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)表達(dá)及其磷酸化水平。對(duì)于單個(gè)蛋白質(zhì)而言，這一方法有助于區(qū)分兩種不同的磷酸化水平改變方式，即直接受激酶調(diào)控，或者通過蛋白質(zhì)表達(dá)量的變化而變化。從系統(tǒng)水平上看，這一方法可以揭示轉(zhuǎn)錄因子磷酸化對(duì)其下游靶基因的調(diào)控關(guān)系。該工作以脂肪細(xì)胞為研究對(duì)象，鑒定到了一些在分化早期磷酸化水平或表達(dá)量發(fā)生顯著變化的蛋白質(zhì)，進(jìn)一步的生物信息學(xué)分析揭示了一些轉(zhuǎn)錄因子磷酸化水平與下游靶基因表達(dá)水平的關(guān)系。這一工作為系統(tǒng)水平上詮釋脂肪細(xì)胞分化早期分子事件提供了研究策略和實(shí)驗(yàn)依據(jù)，發(fā)展的技術(shù)方法也可以廣泛應(yīng)用于信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)分子機(jī)制研究。
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