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哈佛科學家成功將書本內(nèi)容寫進DNA序列

閱讀:589發(fā)布時間:2012-8-31

據(jù)《新科學家》和《科學》雜志8月16日報道,哈佛大學的研究團隊將一本遺傳學課本的全部內(nèi)容編碼進一小段DNA(脫氧核糖核酸)序列,確切來說,是將53400個單詞、11張圖片和一個Java程序共計527萬比特的數(shù)據(jù)存儲在了不到1皮克(10-12克)的DNA中。這項突破有可能*革新我們存儲數(shù)據(jù)的能力。

DNA是已知密度zui高也zui穩(wěn)定的信息存儲介質(zhì)。理論上而言,DNA的每個核苷酸可以編碼兩個比特,每克單鏈DNA的存儲容量可達455艾字節(jié)(1艾字節(jié)=10的18次方字節(jié),1字節(jié)=8比特),大約相當于1000億張DVD光盤的容量,存儲密度幾乎是閃存等現(xiàn)有數(shù)字媒體的五六百倍。而且,存儲在DNA中的數(shù)據(jù)時隔幾千后年仍能夠被讀出。

讀取這些數(shù)據(jù)則需要一個DNA測序儀和一臺計算機。由于每個DNA片段中都包含著一個數(shù)字“條形碼”,記錄了其在原始文件中的位置,因此所有的片段可被重新組裝,并轉(zhuǎn)換成數(shù)字格式。電腦還能幫助糾錯:每個數(shù)據(jù)塊都被復制了數(shù)千次,通過與其他副本相比較,任何一個小錯誤都可以被識別并修復。

研究人員將課本內(nèi)容存入DNA,然后又重新轉(zhuǎn)化為數(shù)字形式讀出,結(jié)果顯示,這個存儲系統(tǒng)的底層讀取錯誤率為每百萬比特只有兩個錯誤,可與DVD比肩,遠遠優(yōu)于磁性硬盤驅(qū)動器。不過,由于數(shù)據(jù)編碼是與DNA合成同步完成的,因此這種方式不支持可擦寫數(shù)據(jù)存儲,但適用于長期歸檔存儲。

此前曾有研究人員嘗試過將數(shù)據(jù)寫進活細胞的基因組內(nèi),但這種方法存在很多問題:首先,一旦細胞死亡,存儲的內(nèi)容將會丟失;其次,細胞會分裂復制,在這一過程中可能會產(chǎn)生新的變異,從而更改存儲數(shù)據(jù)。此外,利用DNA長序列讀取和寫入數(shù)據(jù)存在一定難度,而且成本很高,這使得利用DNA進行大規(guī)模數(shù)據(jù)存儲不太現(xiàn)實。

為了解決這些問題,哈佛醫(yī)學院合成生物學家喬治·丘吉爾帶領(lǐng)的研究團隊不使用細胞,而是用噴墨打印機將化學合成的DNA短片段嵌入到一個微小的玻璃芯片表面。他們將一本由丘吉爾參與編寫的遺傳學課本轉(zhuǎn)換成“0”和“1”的比特形式,并用DNA的4個堿基中的A或C來編碼 “0”,G或T來編碼“1”,從而將課本內(nèi)容寫入了DNA中。這個DNA芯片采用了類似于計算機硬盤分區(qū)的方式,將課本內(nèi)容分散為數(shù)據(jù)塊來存儲。

研究人員表示,因受操作成本、速度(此次花了大約幾天時間)和測序儀大小的制約,將DNA作為一種通用的數(shù)據(jù)存儲介質(zhì)目前還不切實際,但這一領(lǐng)域正在快速發(fā)展,未來5年到10年內(nèi)有望開發(fā)出比傳統(tǒng)數(shù)字存儲設備更快、更小、更便宜的DNA存儲技術(shù)。


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