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最初接觸基因克隆和構(gòu)建載體時,總會遇到這樣那樣的問題,構(gòu)建載體作為很多實驗的必須步驟,不應該成為阻擋后續(xù)實驗的障礙。這是因為通常來說,載體構(gòu)建相關(guān)的問題都過于簡單,下面就來了解一下!
構(gòu)建載體常出現(xiàn)的問題
1、無法成功克隆到基因
2、基因無法成功連接至載體
3、檢測質(zhì)粒時發(fā)現(xiàn)目的基因大小不對
4、檢測質(zhì)粒時發(fā)現(xiàn)大小差不多,但測序結(jié)果不對
一般,在構(gòu)建載體時,能遇到的也就這幾個問題,如果有其他問題存在也大概與上述四個問題是密切相關(guān)的。需要說的是,如果載體構(gòu)建出了狀況,就不要一味的重復了,一遍不成功,十遍也絕不會對。如果出現(xiàn)例外,那絕對是小概率事件。
那出現(xiàn)上述問題后從哪幾方面思考呢?
1、確??寺〉降幕?正確:
如果這一步出問題,無非兩點原因:引物設(shè)計不合理,模板質(zhì)量不高。
解決方法:多找?guī)讉€模板同時進行克??;重新評估引物的合理性和特異性,比如將引物長度增至40 bp左右。
2、關(guān)于酶切
酶切其實要求并不十分嚴格,正常操作下,不論電泳檢測是否十分清楚,酶切產(chǎn)物足夠連接用量了,沒必要糾結(jié)。
3、關(guān)于酶切位點的選擇
這一點很重要。通常很多同學在選擇酶切位點時,會習慣性的選擇師兄師姐們常用的酶切位點,比如BamHI等,但實際上這樣是不行的。此時需要注意:目的基因中不能出現(xiàn)所選酶切位點,否則,在連接時,殘留的酶會對目的基因進行切割,這將直接導致實驗的失敗。
解決辦法:選擇酶切位點前,需要檢查所選酶切位點是否存在于目的基因中。
小結(jié)
總之,如果構(gòu)建載體時出現(xiàn)問題,就從這幾方面一一排除:
引物設(shè)計是否合理?
酶切位點是否選擇正確?
模板質(zhì)量是否較好?
PCR程序是否設(shè)置正確?
如果以上幾點都沒問題,那載體構(gòu)建就不會出問題。
最后,其實不管構(gòu)建載體還是其他實驗,有時做不出來,排除最本質(zhì)的原因之外,如果正常操作下出現(xiàn)狀況,一定是哪一步做錯了或者疏忽了,應該盡量避免一味的機械重復。
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