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如何查找特定基因序列的心得與大家共享,下面以小鼠EDNRB基因?yàn)槔诱f明:
1. 查找一個(gè)基因的啟動(dòng)子之前,是要對(duì)這個(gè)基因做一個(gè)初步的了解
注意:在research下面選擇 Gene 在for后面輸入ednrb
2. 這個(gè)是查找結(jié)果,由于很多哺乳類動(dòng)物都有該基因,查找結(jié)果顯示了很多五種的ednrb基因,我們選擇其中的Mus musculus 這個(gè)是我們要找的小鼠種類,請(qǐng)大家正確選擇自己目標(biāo)基因的動(dòng)物種類,Rattus norvegicus是大鼠的學(xué)名,Mus musculus是小鼠的學(xué)名,由于我的目標(biāo)是小數(shù)的ednrb基因,故選擇Mus musculus。
3: 對(duì)Official Symbol Ednrb and Name: endothelin receptor type B [Mus musculus]
Other Aliases: AU022549, ET-B, ET>B<, ETb, Sox10m1, s
Other Designations: piebald
Chromosome: 14; Location: 14 51.0 cM
Annotation: Chromosome 14, NC_000080.5 (104213843..104242913, complement)
GeneID: 13618
解釋:Official Symbol Ednrb and Name 這個(gè)是官fang對(duì)這個(gè)基因的全稱,也就是內(nèi)皮素受體B 這個(gè)是該基因編碼的蛋白質(zhì)名稱
Other Aliases 該基因的別名
Chromosome: 14; Location: 14 51.0 cM 說明該基因位于第14條染色體上面
Annotation: Chromosome 14, NC_000080.5 (104213843..104242913, complement)
GeneID: 13618
這個(gè)說明基因的堿基分布是104213843到104242913.
4. 該基因的具體信息
5. 以上部分是找到對(duì)該基因的基本信息,在下面Reference assembly (C57BL/6J)上面找到基因具體序列的鏈接,點(diǎn)擊其中的GenBank, ednrb基因堿基的排列就出來了,這里說明 一下,genbank上面給的序列都是與相應(yīng)mRNA互補(bǔ)的序列,也就是模板鏈的序列,也就是-(minus strand) 上面的C57BL/6J是得出該序列的小
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