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由于環(huán)境因素和細(xì)胞內(nèi)正常的新陳代謝過程,DNA損傷每天以每個(gè)細(xì)胞1000到100萬個(gè)分子損傷的速度發(fā)生。雖然這只占人類基因組約60億個(gè)堿基(30億個(gè)堿基對(duì))的一小部分,但關(guān)鍵基因的未修復(fù)損傷可能會(huì)阻礙細(xì)胞發(fā)揮其功能的能力,并顯著增加癌癥的可能性。
彗星實(shí)驗(yàn)(Comet assay)也被稱為單細(xì)胞凝膠電泳實(shí)驗(yàn)(Single cell gel electrophoresis,SCGE),是一種超靈敏的單細(xì)胞水平上檢測DNA損傷的技術(shù),可以檢測到1.657×10-15中0.1個(gè)DNA的斷裂,甚至檢出自然光照射體外淋巴細(xì)胞1h后引起的DNA損傷。在電泳場下,損傷的細(xì)胞DNA(包含碎片和鏈斷裂)從完整的DNA中分離出來,在顯微鏡下形成典型的“彗星尾巴"形狀。DNA損傷的程度通常是通過測量彗星尾巴來目測的,也可以使用圖像分析軟件來測量各種參數(shù)。
Cell Biolabs【彗星分析應(yīng)用領(lǐng)域】:主要還是在細(xì)胞凋亡的研究,腫瘤/癌癥研究,毒理學(xué)研究,環(huán)境污染監(jiān)測,臨床診斷與治療監(jiān)測。
接下來,艾美捷 Cell Biolabs會(huì)給大家分享一下彗星分析實(shí)驗(yàn)(Comet assay)怎么做?
步:Cell Biolabs彗星分析試劑盒不可少(可根據(jù)實(shí)驗(yàn)用量,選擇不同的規(guī)格:)
常用:Comet Assay Kits, 3-Well (3孔玻片)
高通量篩選:Comet Assay Kits, 96-Well(96孔玻片)
艾美捷 Cell Biolabs丨Comet Assay kit彗星分析試劑盒內(nèi)提供了彗星分析所需的所有必需試劑,包括裂解液、彗星分析低熔點(diǎn)凝膠、DNA熒光染料、彗星分析玻片以及其它試劑。
第二步:彗星分析電泳模式選擇:
電泳模式 檢測類型 電泳時(shí)間 說明
TBE電泳(中性電泳)——檢測單鏈和雙鏈DNA的斷裂——推薦10-15 mins——分析細(xì)胞凋亡的shou選方法,可使用尾巴長度而非尾矩進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。
堿性電泳——檢測單鏈和雙鏈DNA的斷裂,AP位點(diǎn)損傷在內(nèi)的所有DNA 損傷——推薦15-30mins——靈敏度zui高!
* 實(shí)驗(yàn)過程中的各類緩沖液都需要4℃預(yù)冷。
關(guān)于電泳電壓:以上2種電泳模式,均推薦參考實(shí)驗(yàn)室電泳槽兩J間的舉例,按照1V/cm的標(biāo)準(zhǔn)設(shè)置電壓。舉例,如果電泳槽兩J舉例是35cm,那么你需要使用35V的電壓來執(zhí)行電泳。
實(shí)驗(yàn)環(huán)境:為避免紫外線對(duì)細(xì)胞樣品造成額外損害,請(qǐng)?jiān)谌豕鈼l件下進(jìn)行。
第三步:彗星分析的典型結(jié)果樣式
如上圖,左側(cè)是健康的Jurkat細(xì)胞(未處理);右側(cè)是使用20 uM Etoposide(依托泊苷)處理4小時(shí)的Jurkat細(xì)胞?!倦娪緱l件:堿性電泳,15mins】
第四步:彗星分析結(jié)果計(jì)算
通過測量細(xì)胞核遺傳物質(zhì)(“彗頭")與產(chǎn)生的“尾巴"之間的位移,可以量化DNA損傷。 尾矩(Tail Moment)和尾巴DNA%(Tail DNA% )是分析彗星分析結(jié)果的兩個(gè)最常見的參數(shù)。 每個(gè)樣品至少應(yīng)分析50 -100個(gè)細(xì)胞。考慮到遺傳物質(zhì)的遷移以及尾巴中DNA的相對(duì)數(shù)量,通常建議使用尾矩作為評(píng)估DNA損傷的指標(biāo)。
Cell Biolabs 配套彗星實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析軟件:
軟件名稱 說明
OpenComet 免費(fèi);是Image J軟件的一款彗星分析插件
CaspLab (CASP) 免費(fèi);獨(dú)立軟件
Comet Assay IV 付費(fèi)軟件;可試用1周
艾美捷科技是Cell Biolabs的中國代理商,為科研工作者提供優(yōu)質(zhì)的彗星分析試劑盒。
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