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IP檢測過程中的重、輕鏈干擾避免方法

閱讀:426發(fā)布時間:2020-7-1

 

免疫沉淀 (Immunoprecipitation,IP) 是利用抗原抗體特異性反應純化富集目的蛋白的一種方法。抗體與細胞裂解液或表達上清中相應的蛋白結合后,再與ProteinA/G偶聯(lián)的agarose或Sepharose珠子孵育,通過離心得到珠子-蛋白A/G-抗體-目的蛋白復合物,沉淀經(jīng)過洗滌后,重懸于電泳上樣緩沖液,煮沸5-10min,在高溫及還原劑的作用下,抗原與抗體解離,離心收集上清,上清中包括抗體、目的蛋白和少量的雜蛋白。

 

在免疫沉淀實驗后的WB驗證環(huán)節(jié)中,當使用常規(guī)的 Anti-IgG (H+L) 酶標二抗時,通常會出現(xiàn)對應免疫沉淀一抗變性后產(chǎn)生的重鏈(50kDa)和輕鏈(25kDa)兩條帶。如果檢測的目的蛋白分子量在此附近時,就會受到這兩條帶的干擾。

 

 

如何避免IP檢測過程中的重、輕鏈干擾?

 

一般解決辦法:選擇不同種屬來源的一抗分別進行IP和WB實驗,然后再選擇無種屬交叉反應的二抗進行WB實驗;這種方案相對來說比較昂貴,需要買兩個一抗和兩個對應的二抗。

 

Abbkine解決方案:產(chǎn)生此問題的重點在于實驗中目的蛋白的信號模糊,無法進行判斷,那就需要在根本上將干擾的信號降到低,而IPKine系列二抗經(jīng)過特別設計和優(yōu)化,可以和重/輕鏈特異性結合從而明顯看到目的蛋白信號。如果目的條帶在55kDa左右,可以通過選擇與輕鏈特異性結合的二抗,來消除重鏈條帶對目的蛋白檢測的干擾。如下圖:

 

 

IPKine是一系列新型的二抗產(chǎn)品,能有效解決IP-WB后的輕/重鏈干擾問題。IPKine系列二抗經(jīng)過特別優(yōu)化,不會與IgG的輕/重鏈分子結合,只識別IgG分子的重/輕鏈部分,從而能有效解決IP實驗后的WB檢測中面臨的輕/重鏈干擾信號降到低。

 

另外,IPKine系列二抗經(jīng)過特別優(yōu)化,其針對目的種屬的特異性非常高,同時針對其他非目的種屬的抗體分子的非特異性結合降到低,從而有效避免了二抗與樣本內(nèi)免疫球蛋白分子的非特異性雜交,提高實驗的特異性和信噪比。

 

IP實驗常見問題匯總:

結果

原因

解析

顯影信號整體很弱,熒光信號淬滅

顯影液失效

通過檢查顯影液清澈度初判,并通過立即更換新顯影液后再曝

底物失效

將PVDF膜重新TBST略洗幾次,重新加合格的底物

二抗孵育過多

如果操作較快,會出現(xiàn)第1張膠片曝光后信號*,而第2張起可能信號淬滅;如果操作稍慢點,甚至第1張膠片起信號基本淬滅,這種情況建議重做,降低二抗?jié)舛取p少孵育時間

條帶正確,但顯影過強或過弱

上樣量過大

可減小上樣量、提高一抗稀釋度并縮短曝光時間

上樣量過小

可增加上樣量、降低一抗稀釋度并延長曝光時間

背景雜亂厚重,大片“黑區(qū)”,導致無法分析

一抗孵育時間過長
或濃度過高

4℃封閉過夜,一抗孵育1 hr,并可適當增加洗膜時間

Input泳道無目的帶,而IP泳道有

目的蛋白豐度不高,無法直接 Western blot 檢出,而 IP 能進行濃縮富集

Input泳道有目的帶,而IP泳道無

該種一抗主要識別和結合靶蛋白內(nèi)部的線性表位、而非暴露在外表的的線性或空間表位,故IP制樣時無法有效捕獲住組織或細胞中的完整結構靶蛋白

該蛋白濃度極低,導致捕獲過程不僅未起到富集作用,反而因為洗滌操作,使靶蛋白損失殆盡,后幾乎無靶蛋白被洗脫下來;或lysis buffer過強;或選用了不正確的beads; 或一抗亞型為 IgM 或 IgA

 

Abbkine專注于蛋白學和細胞學領域,致力于創(chuàng)新和研發(fā)各類抗體、蛋白質(zhì)、分析試劑與試劑盒,以期成為生命科學研究發(fā)展、藥物研發(fā)等領域的關鍵推動者。我們?yōu)槟峁┑鞍缀兔庖哐芯坑脩粝矏鄣漠a(chǎn)品,從免疫學基礎產(chǎn)品,如蛋白提取定量,到免疫學實驗的內(nèi)參標簽抗體、一抗及二抗等;細胞研究用戶喜愛的產(chǎn)品,從用于檢測細胞狀態(tài)的染料及試劑盒,細胞器提取試劑盒,細胞亞結構染色示蹤及細胞代謝檢測產(chǎn)品,到用于細胞培養(yǎng)的細胞因子及蛋白類檢測試劑盒,只為助力您的研究事業(yè)!

 

 


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