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上海邦景實(shí)業(yè)有限公司
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閱讀:298發(fā)布時(shí)間:2017-7-18
干細(xì)胞研究人員報(bào)告稱他們從人類SCLC遺傳工程小鼠模型中分離出了來(lái)自原發(fā)和轉(zhuǎn)移灶的純癌細(xì)胞群,調(diào)查驅(qū)動(dòng)這一致命轉(zhuǎn)移性擴(kuò)散的機(jī)制。通過(guò)確定全基因組的染色質(zhì)可接近性特征,他們揭示出在轉(zhuǎn)移進(jìn)程中整個(gè)基因組許多的遠(yuǎn)端調(diào)控元件開(kāi)啟。這些改變與Nfib基因位點(diǎn)拷貝數(shù)擴(kuò)增相關(guān)聯(lián),Nfib的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)高度富集差異性可接近位點(diǎn)。在大部分的基因間隔區(qū)Nfib是提高染色質(zhì)可接近性的必要及充分條件。Nfib促進(jìn)了促轉(zhuǎn)移神經(jīng)元基因程序,并驅(qū)動(dòng)了SCLC細(xì)胞的轉(zhuǎn)移能力。
當(dāng)研究小組分析RNA和蛋白質(zhì)豐度的時(shí)候,也發(fā)現(xiàn)了類似的模式——在夜間喂食的小鼠整個(gè)活動(dòng)期間這兩者水平都出現(xiàn)了上升。相比之下,白天喂養(yǎng)的小鼠中RNA和蛋白質(zhì)的水平?jīng)]有變化,所有動(dòng)物的DNA水平都是保持不變,因此表明肝細(xì)胞數(shù)并沒(méi)有發(fā)生晝夜變化。
研究人員利用Fluidigm的C1單細(xì)胞全自動(dòng)制備系統(tǒng)來(lái)制備單細(xì)胞,并在Illumina的HiSeq 2500系統(tǒng)上開(kāi)展全外顯子組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。他們從單細(xì)胞RNA-Seq數(shù)據(jù)中推斷出拷貝數(shù)變異(CNV),幫助確定不同的癌癥群體。比如,研究人員發(fā)現(xiàn)三陰癌細(xì)胞表達(dá)更具侵襲性的癌癥特征,如參與上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化和血管生成的基因。
過(guò)去,研究人員通常采用免疫染色來(lái)評(píng)估免疫細(xì)胞群體。如今,評(píng)估CNV把整個(gè)流程縮短,因此,這項(xiàng)新技術(shù)可為臨床應(yīng)用提供更快的周轉(zhuǎn)時(shí)間。Park及其團(tuán)隊(duì)計(jì)劃使用這種單細(xì)胞技術(shù)來(lái)分析其他癌癥類型,如肺癌。
干細(xì)胞HAF 人主動(dòng)脈成纖維細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HCM 人心肌細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HCM-a 人心肌細(xì)胞-成人 5 x 10^5 cells/vial
HCF 人心臟成纖維細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HCF-av 人心臟成纖維細(xì)胞-成人心室 5 x 10^5 cells/vial
HCF-aa 人心臟成纖維細(xì)胞-成人心房 5 x 10^5 cells/vial
HCEpiC 人角膜上皮細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HK 人角膜細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HREC 人視網(wǎng)膜內(nèi)皮細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HRPEpiC 人視網(wǎng)膜色素上皮細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HLEpiC 人晶狀體上皮細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HIPEpiC 人虹膜色素上皮細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HConF 人結(jié)膜成纖維細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HNPCEpiC 人無(wú)色素睫狀上皮細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HTMC 人小梁網(wǎng)細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HOCF 人眼球脈絡(luò)膜成纖維細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HConEC 人結(jié)膜上皮細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HVCEC 人絨毛膜毛細(xì)血管內(nèi)皮細(xì)胞 1 x 10^6 cells/vial
HAmEpiC 人羊膜上皮細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HVT 人絨毛膜滋養(yǎng)層細(xì)胞 1 x 10^6 cells/vial
HVMF 人絨毛間充質(zhì)成纖維細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HAMSC 人羊膜間充質(zhì)基質(zhì)細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HCMSC 人絨毛膜間充質(zhì)基質(zhì)細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HAMEC 人脂肪微血管內(nèi)皮細(xì)胞 1 x 10^6 cells/vial
HPA-v 人前脂肪細(xì)胞-內(nèi)臟 1 x 10^6 cells/vial
HPA-s 人前脂肪細(xì)胞-皮下 1 x 10^6 cells/vial
HOMEC 人卵巢微血管內(nèi)皮細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HOSEpiC 人卵巢表層上皮細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HOF 人卵巢成纖維細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HAMSC 人羊膜間充質(zhì)基質(zhì)細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HCMSC 人絨毛膜間充質(zhì)基質(zhì)細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HMSC-bm 人骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HMSC-ad 人脂肪間充質(zhì)干細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HMSC-hp 人肝臟間充質(zhì)干細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HUMSC 人臍帶間充質(zhì)干細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HPMSC 人肺間充質(zhì)干細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial
HVMSC 人脊柱間充質(zhì)干細(xì)胞 5 x 10^5 cells/vial干細(xì)胞
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