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根據(jù)培養(yǎng)基的用途來區(qū)分，可分為選擇培養(yǎng)基、增殖培養(yǎng)基、鑒別培養(yǎng)基等。

1）殺死或抑制不想要的植物生長培養(yǎng)基的選擇性培養(yǎng)基添加物質(zhì)的介質(zhì)，介質(zhì)的選擇。如鏈霉素，氯霉素抑制原核微生物的生長；制霉菌素，灰黃霉素能抑制真核微生物的生長；結(jié)晶紫能抑制革蘭氏陽性細菌的生長。結(jié)晶紫能抑制革蘭氏陽性細菌的生長。

2）自然增殖培養(yǎng)基，不同種類的微生物往往生活在一起，為了將我們需要加一些特殊的微生物，在介質(zhì)中的微生物對營養(yǎng)物質(zhì)的愛，以增加該生物的繁殖率，并逐步消除其他微生物，這種介質(zhì)稱為介質(zhì)的擴散介質(zhì)，用于篩選和選擇性富集。在某種程度上是一種選擇性培養(yǎng)基，增殖培養(yǎng)基。

3）一些試劑或化學(xué)介質(zhì)的文化附加鑒別培養(yǎng)基，培養(yǎng)基表現(xiàn)出明顯的差異是很難區(qū)分的，從而幫助某些微生物的快速鑒定。這樣的媒體稱為分化培養(yǎng)基。例如，檢查水和乳制品中的腸道致病菌，伊紅美藍瓊脂的存在是一種歧視性的普通培養(yǎng)基。