SSR分子標(biāo)記實驗:
實驗步驟
1、玻璃板清洗:
1)用洗滌劑把玻璃反復(fù)擦洗干凈,用酒精擦干、干燥。在疏水玻璃板上均勻涂上300-500μL的0.5%的疏水劑Binding Silane??煞胖靡?。
2)配制凝膠前,在親水玻璃板上均勻涂上2%的親水劑Repel Silane,保證玻璃板的每個地方都涂上親水劑,晾干至少5min,然后用酒精輕輕擦拭以去掉多余的親水劑。
Y1細(xì)胞,小鼠腎上腺皮質(zhì)細(xì)胞
YAC-1細(xì)胞,小鼠淋巴瘤細(xì)胞
ZR-75-1細(xì)胞,人乳腺癌細(xì)胞
ZR-75-30細(xì)胞,人乳腺癌細(xì)胞
293細(xì)胞 人胚腎細(xì)胞
293T細(xì)胞人胚腎細(xì)胞
293T/17細(xì)胞 人胚腎細(xì)胞
2V6.11細(xì)胞 人胚腎細(xì)胞
3T3-L1細(xì)胞 小鼠胚胎成纖維細(xì)胞
4T1細(xì)胞 小鼠乳腺癌細(xì)胞
3)玻璃板*干燥后進(jìn)行玻璃板組裝。兩塊玻璃板兩邊邊緣割傷配套的硬紙條,橡皮夾子夾住兩邊,在橡皮夾子里加上硬紙片可以保證玻璃板的水平,可以有效地防止條帶跑歪。下邊套上有旋鈕的塑料套,旋緊旋鈕,以防止底下漏膠在插入梳子的位置插入一個硬紙條以保證上方凝膠界面水平且整齊。
4)將裝好的玻璃板水平放置于桌面上,親水玻璃板至于下面,而帶電極的疏水玻璃板朝上,保證玻璃板的水平。
2、聚丙烯酰胺凝膠的制備
1)每一塊膠的用量配制如下:(大膠)
Urea-TBE 51ml
40%丙烯酰胺 9ml
10%APS 400μl
TEMED 30μl
共計 約60ml
2)迅速輕輕搖勻,注意不要用力攪拌,混勻后立即灌膠。
3)將混合液導(dǎo)入大注射器中,將導(dǎo)管中氣泡擠出,迅速將導(dǎo)管口插入灌膠口,在重力作用下,混合液流入兩塊玻璃板之間,人為控制流速以防止氣泡產(chǎn)生。
4)灌膠完成后,聚合時間至少在1小時,若凝膠要放置夜,則須在凝膠兩頭鋪上濕濾紙(以1×TBE浸濕)以防止凝膠變干。4℃保存,凝膠使用之前可保存1-2天。
3、凝膠電泳
1)正極槽(底下)中加入600ml的1×TBE緩沖液,組裝上配好凝膠的玻璃板,拔去維持凝膠上方水平的硬紙條,負(fù)極槽上加入800ml的0.5×TBE緩沖液直至覆蓋了凝膠上方。
A9細(xì)胞 小鼠皮下結(jié)締組織細(xì)胞
AAV-293細(xì)胞 人胚腎細(xì)胞
Acc-2細(xì)胞人涎腺腺樣囊性癌細(xì)胞
Acc-3細(xì)胞人涎腺腺樣囊性癌細(xì)胞
ACHN細(xì)胞 人腎細(xì)胞腺癌細(xì)胞
AGS細(xì)胞 人胃腺癌細(xì)胞
AML-193細(xì)胞 人急性單核細(xì)胞白血病單核細(xì)胞
Ana-1細(xì)胞 小鼠巨噬細(xì)胞
AR42J細(xì)胞大鼠胰腺外分泌細(xì)胞
2)將凝膠上方多余的膠用槍沖洗干凈,并將氣泡清除。
3)預(yù)電泳30min,保持在恒定功率55W(相當(dāng)于電壓1441V,電流38mA)。
4)預(yù)電泳完成后,關(guān)閉電源,用槍將凝膠上方多余的氣泡和膠清除干凈,插入梳子,再用槍將梳子中的氣泡清除干凈。
5)加入3μl已由loading buffer處理過的樣品DNA,每塊板子可點1-3個Marker,55W恒定功率電泳1.5h,至*條Loading buffer指示帶(二甲苯青帶,約相當(dāng)于260bp雙鏈DNA)跑至膠板的2/3處(距底部1/3處)時停止電泳。
6)通過帶電極玻璃板中部的出水孔排出0.5×TBE緩沖液,剩余的0.5×TBE緩沖液直接倒掉,緩沖液可反復(fù)使用幾次。
95-D細(xì)胞人高轉(zhuǎn)移肺癌細(xì)胞
A172細(xì)胞人膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞
A3細(xì)胞 人T淋巴細(xì)胞白血病細(xì)胞
J82細(xì)胞人膀胱移行細(xì)胞癌
A-431細(xì)胞 人表皮癌細(xì)胞
A549細(xì)胞人非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞
A-673細(xì)胞 人橫紋肌瘤細(xì)胞
A7r5細(xì)胞 大鼠胸大動脈平滑肌細(xì)胞
7)小心的分開兩塊玻璃板,這時凝膠會粘連在涂有親水劑的玻璃板上。
4、銀染
1)將帶凝膠的玻璃板浸在固定液(10% 乙醇,0.5% 冰醋酸)中20min,凝膠朝下放置,玻璃板位于上方。
2)將玻璃板取出,浸在染色液(10% 乙醇,0.5% 冰醋酸,0.2% AgNO3 (ACS 試劑))中15min,凝膠朝下放置,玻璃板位于上方。
3)用自來水(用雙蒸水)短時間(5-10s)沖洗玻璃板兩面,玻璃板須離水近些,否則凝膠容易變黑。
4)將凝膠浸在顯影液(3%NaOH,0.1%甲醛)中,顯影20-30min,直至帶紋出現(xiàn)。凝膠朝上放置。
5)用自來水(用雙蒸水)沖洗凝膠兩遍,每次2min。
6)室溫下自然干燥,干燥后的膠板覆蓋保鮮膜,可以*保存,也可以進(jìn)行拍照記錄。
TE-10細(xì)胞,人食管癌細(xì)胞
TE-1細(xì)胞,人食管癌細(xì)胞
Tca-8113細(xì)胞,人舌鱗癌細(xì)胞
T-47D細(xì)胞,人乳腺管癌細(xì)胞
T24細(xì)胞,人膀胱移行細(xì)胞癌細(xì)胞
WEHI 231細(xì)胞,小鼠B 淋巴細(xì)胞
WI-38細(xì)胞,人胚肺細(xì)胞
WISH細(xì)胞,人羊膜細(xì)胞
5637細(xì)胞人膀胱癌細(xì)胞
6T-CEM細(xì)胞 人T細(xì)胞白血病細(xì)胞
769-P細(xì)胞 人腎細(xì)胞腺癌細(xì)胞
786-0細(xì)胞 人腎透明細(xì)胞腺癌細(xì)胞
AsPC-1細(xì)胞 人轉(zhuǎn)移胰腺腺癌細(xì)胞
AtT-20細(xì)胞 小鼠垂體瘤細(xì)胞
B16細(xì)胞 小鼠黑色素瘤細(xì)胞
BxPC-3細(xì)胞 人原位胰腺腺癌細(xì)胞
BT-549細(xì)胞 人乳腺管癌細(xì)胞
BT474細(xì)胞 人乳腺導(dǎo)管癌細(xì)胞
BRL 3A細(xì)胞 大鼠肝細(xì)胞
BRL細(xì)胞 大鼠肝細(xì)胞
BNL CL.2細(xì)胞 小鼠胚胎肝細(xì)胞
BGC-823細(xì)胞 人胃腺癌細(xì)胞
Beta-TC-6細(xì)胞 小鼠胰島素瘤胰島β細(xì)胞
BEL-7405細(xì)胞 人肝癌細(xì)胞
BEL-7404細(xì)胞 人肝癌細(xì)胞
BEL-7402細(xì)胞 人肝癌細(xì)胞
BEAS-2B細(xì)胞 人正常肺上皮細(xì)胞
Bcap-37細(xì)胞 人乳腺癌細(xì)胞
B95-8細(xì)胞 絨猴EBV轉(zhuǎn)化的白細(xì)胞
B16-F10細(xì)胞 小鼠皮膚黑色素瘤細(xì)胞
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