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PCR技術(shù)

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  1導(dǎo)論
  
  多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PolymeraseChainReaction,PCR)是美國(guó)Perkin-Elmer/Cetus公司人類遺傳研究室MullisK.B.等人于1985年發(fā)明的一種快速體外DNA片段擴(kuò)增技術(shù),是八十年代分子生物學(xué)資源領(lǐng)域的一項(xiàng)革命性突破,被譽(yù)為分子生物學(xué)資源發(fā)展*的又一里程碑。該技術(shù)一問(wèn)世,就在分子生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、生物工程、法醫(yī)學(xué)、考古學(xué)等領(lǐng)域得到快速而廣泛的應(yīng)用,并且對(duì)已建立的基因克隆、DNA序列分析等現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展也起了巨大的推動(dòng)作用。
  
  PCR技術(shù)是一種模擬自然DNA復(fù)制過(guò)程的體外酶促合成特異性核酸片段技術(shù)(亦稱無(wú)細(xì)胞分子克隆技術(shù))。它以待擴(kuò)增的兩條DNA鏈為模板,由一對(duì)人工合成的寡核苷酸作為介導(dǎo),通過(guò)DNA聚合酶促反應(yīng),在體外進(jìn)行特異DNA序列擴(kuò)增。其過(guò)程包括模板變性(deNature)、引物退火(annealing)和用DNA聚合酶延伸(clongation)退火引物在內(nèi)的重復(fù)循環(huán)系列,使末端被引物5’端限定的特異性片段成指數(shù)形式累積。由于在每一循環(huán)中合成的引物延伸產(chǎn)物可作為下一循環(huán)中的模板,因而每次循環(huán)中靶DNA的拷貝數(shù)幾乎呈幾何級(jí)數(shù)增長(zhǎng)。因此20次PCR循環(huán)將產(chǎn)生約一百萬(wàn)倍(220)的擴(kuò)增產(chǎn)物,具有操作簡(jiǎn)單、快速、靈敏度高、特異性強(qiáng)的特點(diǎn),并且具有從DNA粗制品和降解的DNA模板中擴(kuò)增靶序列的能力,這一點(diǎn)在生藥鑒定應(yīng)用中尤為重要。
  
  PCR的原理類似于DNA的天然復(fù)制過(guò)程,關(guān)鍵是運(yùn)用兩個(gè)起始引物,分別為待擴(kuò)增序列的相對(duì)的兩條單鏈DNA結(jié)合,結(jié)合位點(diǎn)分別位于待擴(kuò)增序列的兩端,并且3’端相對(duì),然后利用dna聚合酶依賴于DNA模板的特性,模仿體內(nèi)的復(fù)制,在兩個(gè)引物之間誘發(fā)聚合酶反應(yīng)。PCR反應(yīng)可以簡(jiǎn)述如下:
  
  在微量離心管中加入適量緩沖液,加微量模板DNA,四種脫氧單核苷酸(dNTP),耐熱Taq聚合酶及兩個(gè)合成DNA引物,并有Mg2+存在。
  
  1、加熱使模板DNA在高溫下(95℃左右)變性,雙鏈DNA解開(kāi)而變成單鏈DNA游離于溶液中。這是所謂變性階段。
  
  2、PCR的引物是兩段人工合成的寡核苷酸鏈,長(zhǎng)度為16-24個(gè)核苷酸殘基,其順序由被擴(kuò)增的DNA片段兩端的序列決定。這兩段寡核苷酸鏈分別與模板DNA的正鏈和負(fù)鏈互補(bǔ),所互補(bǔ)的位點(diǎn)一個(gè)在被擴(kuò)增序列的“上游”,一個(gè)在被擴(kuò)增序列的“下游”。高溫使模板DNA變性成單鏈以后,溫度降低,由于pcr反應(yīng)體系中引物的拷貝數(shù)遠(yuǎn)遠(yuǎn)多于模板DNA的拷貝數(shù),因而引物與模板DNA形成復(fù)合物的機(jī)率要大大高于模板DNA兩條單鏈的重新結(jié)合。只要嚴(yán)格地控制復(fù)性的條件,復(fù)性過(guò)程是傾向于形成引物與模板的復(fù)合物的。這是退火階段。
  
  3、溶液反應(yīng)溫度升至中溫(72℃),在taq酶作用下,以dNTP為原料,引物為復(fù)制起點(diǎn),模板DNA的一條雙鏈在解鏈和退火之后延伸為兩條雙鏈。這是延伸階段。
  
  如此重復(fù),改變反應(yīng)溫度,即高溫變性,低溫退火,中溫延伸三個(gè)階段。這三次改變溫度為一個(gè)循環(huán)。每循環(huán)一次,使特異區(qū)段基因拷貝數(shù)擴(kuò)大一倍,一般30次循環(huán),基因放大數(shù)可達(dá)2n倍??捎霉?br />  
  Y=(1+X)n
  
  表示,式中Y=DNA擴(kuò)增倍數(shù),X=擴(kuò)增效率,循環(huán)數(shù)為n。
  
  如X=100%,n=20時(shí),Y=1048576倍。但實(shí)際擴(kuò)增效率(X)不會(huì)達(dá)到100%。
  
  2試驗(yàn)條件
  
  本程序適用于自動(dòng)PCR操作,可適用于大多數(shù)情況,所用酶是不含核酸外切酶活性的熱穩(wěn)定聚合酶,如Taq聚合酶等。
  
  【藥品試劑】
  
  引物(各50pmol)
  
  0.2mmol/LdNTPs(必須使用高質(zhì)量的dNTPs,這一點(diǎn)非常重要。dNTPs經(jīng)反復(fù)化凍后會(huì)發(fā)生降解,因此應(yīng)分成小份保存。應(yīng)注意混合物中四種dNTP的量要相等)
  
  模板DNA:約0.05~1mg基因組DNA或0.002~0.02mg質(zhì)粒DNA
  
  TaqDNA聚合酶(PerkinElmer,Norwalk,Connecticut)
  
  10×PCR緩沖液(500mmol/LKCl,15mmol/LMgCl2,100mmol/LTris·HCl,pH8.3)
  
  礦物油
  
  電泳所需試劑

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