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826次標(biāo)準(zhǔn)的PCR過程分為三步(如圖所示):
<img alt="PCR步驟" pcr步驟"="" border="1" height="199" data-cke-saved-src="http://www.bio1000.com/uploads/allimg/120504/1059292160-0.jpg" src="http://www.bio1000.com/uploads/allimg/120504/1059292160-0.jpg" width="141" style="vertical-align: middle; border: 0px;">
1.DNA變性(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,
氫鍵斷裂,形成單鏈DNA
2.退火(復(fù)性)(40℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與
DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈。
3.延伸(68℃-75℃):在taq酶(在72℃左右*的活
性)的作用下,以dNTP為原料,從引物的5′端→3′ 端延
伸,合成與模板互補(bǔ)的DNA鏈。
每一循環(huán)經(jīng)過變性、退火和延伸,DNA含量既增加一倍。
現(xiàn)在有些PCR因?yàn)閿U(kuò)增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是*也能在很短的時間內(nèi)復(fù)制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進(jìn)行,以減少一次升降溫過程,提高了反應(yīng)速度。
循環(huán)參數(shù)
1、預(yù)變性(Initial denaturation).
模板DNA*變性對PCR能否成功至關(guān)重要,一般95℃加熱3-5分鐘。
2、引物退火(primer annealing)
退火溫度一般需要憑實(shí)驗(yàn)(經(jīng)驗(yàn))決定。
退火溫度對PCR的特異性有較大影響。
3、引物延伸
引物延伸一般在72℃進(jìn)行(Taq酶zui適溫度)。
延伸時間隨擴(kuò)增片段長短及所使用Taq酶的擴(kuò)增效率而定。
4、循環(huán)中的變性步驟
循環(huán)中一般95℃,30秒足以使各種靶DNA序列*變性:
變性時間過長損害酶活性,過短靶序列變性不*,易造成擴(kuò)增失敗。
5、循環(huán)數(shù)
大多數(shù)PCR含25-35循環(huán),過多易產(chǎn)生非特異擴(kuò)增。
6、zui后延伸
在zui后一個循環(huán)后,反應(yīng)在72℃維持5-15分鐘.使引物延伸*,并使單鏈產(chǎn)物退火成雙鏈。
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