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士鋒生物用SDS―聚丙烯酰凝膠電泳法測定蛋白質(zhì)的分子量

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一、原理
SDS 是一種陰離子表面激活劑,在蛋白質(zhì)溶液里加入 SDS 和巰基乙醇后,巰基乙醇能使蛋白質(zhì)分子中的二硫鍵還原; SDS 能使蛋白質(zhì)的氫鍵、疏水鍵打開并結(jié)合到蛋白質(zhì)分子上,形成蛋白質(zhì) -SDS 復(fù)合物。在一定條件下,SDS 與大多數(shù)蛋白質(zhì)的結(jié)合比例為 1.4g SDS/1g 蛋白質(zhì)。由于十二烷基硫酸根帶負(fù)電,使各種蛋白質(zhì)的 SDS- 復(fù)合物都帶上相同密度的負(fù)電荷,它的量大大超過了蛋白質(zhì)原有的電荷量,因而掩蓋了不同種類蛋白質(zhì)間原有的電荷差別。SDS 與蛋白質(zhì)結(jié)合后,還引起了蛋白質(zhì)構(gòu)象的改變。蛋白質(zhì) -SDS 復(fù)合物的流體力學(xué)和光學(xué)性質(zhì)表明,它們在水溶液中的形狀,近似于雪茄煙形的長橢圓棒,不同蛋白質(zhì)的 SDS 復(fù)合物的短軸長度都一樣,約為 1.8nm ,而長軸則隨蛋白質(zhì)的 M r 成正比的變化?;谏鲜鲈?,蛋白質(zhì) -SDS 復(fù)合物在凝膠電泳中的遷移率,不再受蛋白質(zhì)原有電荷和形狀的影響,而只與橢圓棒的長度有關(guān), 也就是蛋白質(zhì) M r 的函數(shù)。
二、設(shè)備
1.垂直板電泳槽一套 2.直流穩(wěn)壓電源(500伏、100毫安)
3.抽氣裝置 410毫升注射器、100微量注射器各一支。
三、試劑
1.丙烯酰胺(Acr)貯液:30Acr, 0.8克甲叉雙丙酰胺(Bis)。加水溶解定容至100毫升,過濾后使用,4下可貯藏1-2個(gè)月。
210%SDS溶液。
310%的過硫酸銨溶液。
4.四甲基乙二胺(TEMED)。
5.分離膠緩沖液:1.0M pH8.8Tris-鹽酸緩沖液,將12.1克用水溶解后,用6M鹽酸調(diào)至pH8.8,用水定容至100毫升。
6.濃縮膠緩沖液,1.0M pH6.8Tris-鹽酸緩沖液,將12.1Tris用水溶解后用6M鹽酸調(diào)至pH6.8,用水定容至100毫升。
7.電極緩沖液:將30.3Tris 28.8克甘氨酸和2SDS用水溶解后定容至200毫升,pH應(yīng)為8.3,用時(shí)稀釋10倍。
82X樣品緩沖液,將2SDS,5毫升β-巰基乙醇,10毫升甘油,2.0毫升0.1%溴酚藍(lán)和2毫升試劑(6)混合,用水溶解并稀釋到50毫升。樣品為固體則稀釋1倍使用,若為液體,則等量混合。
90.1%溴酚藍(lán)溶液。
10.已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)蛋白(M10 萬)4-6種。
11.未知分子量的蛋白質(zhì)樣品。
12.考馬斯亮藍(lán)溶液:稱取0.25克考馬斯亮藍(lán)R250,加入45毫升甲醇,10毫升冰醋酸和45毫升水,過濾后使用。
13.脫色液:37.5毫升冰醋酸。25毫升甲醇,加水至500毫升。
14SDS的重結(jié)晶:50SDS100毫升無水乙醇,70下保溫溶解。趁熱過濾后,于低溫下過夜結(jié)晶,過濾,用少量無水乙醇或乙洗滌二次,于真空干燥器內(nèi)干燥。
四、操作程序
1.電泳槽板的安裝(略)
2.制膠
SDS―聚丙烯酰凝膠電泳法測定蛋白質(zhì)的分子量

按上表比例配制分離膠,本實(shí)驗(yàn)分離膠濃度為12%?;靹蚝髮⒛z液沿玻璃板壁緩緩地注入已準(zhǔn)備好的凝膠模子中,注膠過程防止氣泡產(chǎn)生,膠液加到玻璃板頂部3厘米處,立即用注射器覆蓋3-5毫米厚的水層,垂直靜置聚合。
按上表比例配制濃縮膠,立即將膠液注入膠模內(nèi),插好樣品梳。樣品梳的下端應(yīng)距分離膠1厘米,濃縮膠高約3厘米,聚合后,小心地取出樣品梳。
3.樣品處理及上樣
準(zhǔn)確吸取蛋白質(zhì)樣品0.5毫升,加入0.5毫升的樣品緩沖液,在45水浴中保溫1 小時(shí),或在沸水中加熱2-3 分鐘,蛋白質(zhì)在SDSβ-巰基乙醇的作用下,變性,形成緊密的棒狀SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物。蛋白質(zhì)濃度在0.5mg/ml左右為宜。用微量注射器吸取50微升樣品。注入點(diǎn)樣孔中。
4.電泳,加樣后,向兩槽內(nèi)注入電極緩沖液,接通電源,上槽接電源負(fù)極,下槽接正極,開始控制電流為15-20毫安,染料進(jìn)入分離膠后,加大到30毫安,電壓在80-120伏。當(dāng)指示染料到達(dá)膠長的四分之三以上時(shí),即可停止電泳,電泳約需3-4小時(shí),若用盤狀電泳。當(dāng)初始電流控制在每管1毫安,樣品進(jìn)入分離膠后,增大到每管2-3毫安,維持恒流,電泳約需3小時(shí)。
5.染色 膠取出后,在水中浸泡10分鐘,浸出部分SDS,并用細(xì)銅絲對溴酚藍(lán)帶的位置進(jìn)行標(biāo)記,然后浸入考馬斯亮藍(lán)R250溶液中,30染色1小時(shí),然后用水沖洗去凝膠表面的染料,放入脫色液中,于37下脫色1-2天,期間要經(jīng)常更換脫色液。
五.結(jié)果計(jì)算
SDS-PAGE 低分子量標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)
SDS―聚丙烯酰凝膠電泳法測定蛋白質(zhì)的分子量
以相對遷移率(mR)為橫坐標(biāo),相對分子量(Mr)的對數(shù)值為縱坐標(biāo)。
在半對數(shù)坐標(biāo)紙上作圖,可得到一條直線,然后根據(jù)未知蛋白的遷移率,在半
對數(shù)坐標(biāo)上查出其對應(yīng)的分子量。
五、注意事項(xiàng)
1.在不連續(xù)體系SDS-PAGE,當(dāng)分離膠加完后,需在其上加一層水。
2.樣品液在加樣前需在沸水中加熱幾分鐘。
3.電泳時(shí),電流不可太大,太大會(huì)燒膠。電泳一般需要放在冰箱中進(jìn)行,以便于散熱。

 

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