在基因工程中， DNA 分子的切割是由限制性內(nèi)切酶來完成的。限制性內(nèi)切酶能識別特定的 DNA 序列，在一定的條件下切斷雙鏈 DNA 。限制性內(nèi)切酶的作用效率是受多方面因素影響的，如反應溫度，緩沖體系，離子種類與濃度， DNA 的純度和甲基化程度等。對 DNA 進行酶切時，首先要選擇適合的緩沖液。對于單酶切，應選用該酶的zui適緩沖液；對于雙酶切或三酶切，應選用一種能使所有酶都充分作用的緩沖液。 DNA 的純度對于酶切的效果的影響也很大，因為蛋白質(zhì)。酚。氯仿。 SDS 等雜質(zhì)都會抑制限制性內(nèi)切酶的活性。 
瓊脂糖凝膠電泳是分離，鑒定和純化 DNA 片段的常規(guī)方法。利用低濃度的熒光嵌入染料 - 溴化乙錠進行染色，可確定 DNA 在凝膠中的位置。如有必要，還可以從凝膠中 回收 DNA 條帶，用于各種克隆操作。瓊脂糖凝膠的分辨能力要比聚丙烯酰胺凝膠低，但其分離范圍較廣。用各種濃度的瓊脂糖凝膠可以分離長度為 200bp 至近 50kbp 的 DNA 。長度 100kb 或更大的 DNA ，可以通過電場方向呈周期性變化的脈沖電場凝膠電泳進行分離。 
在基因工程的常規(guī)操作中，瓊脂糖凝膠電泳應用。它通常采用水平電泳裝置，在強度和方向恒定的電場下進行電泳。 DNA 分子在凝膠緩沖液（一般為堿性）中帶負電荷，在電場中由負極向正極遷移。 DNA 分子遷移的速率受分子大小，構(gòu)象。電場強度和方向，堿基組成，溫度和嵌入染料等因素的影響。 

三 ． 實驗材料和試劑： 
1． 菌種： 含 pUC18 的大腸桿菌 JM107 菌株。 
2． 化學試劑和溶液 
（1） LB 培養(yǎng)基： 
NaCl 10g/l 酵母提取物 5g/l 
胰蛋白胨 10g/l 氨芐青霉素 50 μ g/ml （培養(yǎng)基滅菌后加入） 
pH7.0 
（2） 70% 乙醇（ -20 ℃）及無水乙醇（ -20 ℃） 
（3） STET 緩沖液（ pH8.0 ）（ 8% 蔗糖， 0.5%Triton, 50mmol/L EDTA,,10mmol/L Tris ） 
（4） 5%CTAB （十六烷基*基溴化氨） 
（5） 1.2M 氯化鈉 
（6） TE 緩沖液（ 10mmol/L Tris-HCl, 1mmol/L EDTA ） 
（7） 電泳緩沖液（ 50XTAE ） 
Tris 242g， 冰醋酸 57.1ml，EDTA(0.5mol/LpH8.0) 100ml 
使用時用蒸餾水稀釋 50 倍。 
（8） 樣品緩沖液（ 6X ） 
0.25% 溴酚藍， 0.25% 二甲苯青， 40% （ W/V ）蔗糖 
（9） 溴化乙錠 10mg/ml 
（10） 瓊脂糖（電泳級） 
（11） 限制性內(nèi)切酶 
（12） 溶菌酶（ 50mg/ml ，溶于 10mmol/L Tris-HCl ， pH 8.0 ） 
3.儀器設備: 
臺式離心機、超凈工作臺、高壓滅菌鍋、恒溫振蕩培養(yǎng)箱、恒溫水浴箱等。 
Eppendorf 離心管， Tip 頭，三角瓶等滅菌備用。 
電泳儀，電泳槽，樣品梳，微波爐，水浴鍋，移液器（ 20ul, 200ul 和 1000ul ），離心管， Tips(200ul,1000ul) 。