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研究闡述血液中細(xì)胞特異性的DNA甲基化改變

時間:2020-11-20閱讀:375
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近期,中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所(中國科學(xué)院-馬克斯·普朗克科學(xué)促進(jìn)學(xué)會計算生物學(xué)伙伴研究所)研究員Andrew Teschendorff課題組與研究員汪思佳課題組合作

吸煙是一些復(fù)雜疾病的主要危險因素。表觀遺傳改變,特別是DNA甲基化(DNAm)的改變,被認(rèn)為在提高疾病發(fā)生風(fēng)險過程中發(fā)揮重要作用。大量已有的表觀基因組關(guān)聯(lián)研究(EWAS)通過繪制血液中DNAm改變的圖譜,探究吸煙如何影響正常細(xì)胞DNA甲基化。然而,血液由多種不同類型的細(xì)胞組成,因此,學(xué)界尚不清楚哪些特定的細(xì)胞類型更可能受到吸煙的影響。

研究團(tuán)隊*通過細(xì)胞特異性的方式對血液EWAS進(jìn)行Meta分析以解決該問題。研究人員收集并分析來自7個獨立EWAS隊列的DNA甲基化數(shù)據(jù),其中包括對吸煙相關(guān)DNAm變化進(jìn)行全面分析的中國隊列。研究發(fā)現(xiàn),與吸煙有關(guān)的DNAm變化在很大程度上與種族無關(guān),佐證將多種族隊列合并進(jìn)行Meta分析的合理性。Meta分析進(jìn)一步揭示血液中大多數(shù)吸煙相關(guān)的DNAm變化如何在骨髓細(xì)胞系內(nèi)發(fā)生,且主要出現(xiàn)在炎性單核細(xì)胞和巨噬細(xì)胞的DNase超敏位點上。新發(fā)現(xiàn)的與吸煙相關(guān)的髓樣特異性DNAm信號與急性髓系白血病相關(guān),吸煙是急性髓細(xì)胞白血病的中度危險因素,然而,在淋巴細(xì)胞系內(nèi)未發(fā)現(xiàn)太多與吸煙相關(guān)的DNAm改變

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